ITRAQ、TMT标记定量蛋白质组研究

iTRAQ是一种由ABSCIEX公司开发的同位素标记技术,用于相对和绝对定量蛋白质。该技术能同时比较8种样品的蛋白表达,适用于多种类型的蛋白质分析,包括胞浆蛋白、膜蛋白等。实验步骤包括样品准备、蛋白处理、iTRAQ标记和LC-MS-MS分析。其优势在于高灵敏度、高通量和广泛的样本兼容性。

1、实验介绍

同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术由AB SCIEX公司研发的一种体外同种同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。

2、实验步骤:

2.1样品准备:将待测样品进行定量计算出样品蛋白浓度;

2.2蛋白还原烷基化及酶解:每组样品各取100μg按照iTRAQ试剂盒要求进行处理,使用测序级胰蛋白酶溶液酶解后,超滤管离心收集酶解肽段;

2.3 iTRAQ标记:将ITRAQ试剂平衡到室温,用150μL异丙醇溶解,取酶解肽段加入iTRAQ试剂后室温反应2 h,加入水终止反应,等量混合不同组样品,真空冷冻干燥样品: .

2.4 LC-MS-MS分析:使用Thermo的Q-Exactive Orbitrap进行串联质谱鉴定。

2.5数据处理及生信分析

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