临床基因测序数据解读
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荞麦agan
这个作者很懒,什么都没留下…
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临床基因测序数据解读技巧-手把手教你如何运用SplicAI预测变异位点是否影响剪接
案例:探针:NanoWES_hg38;基因:QARS1;突变位置:chr3:49099957-49099959;经OMIM数据库查询,该基因QARS1与小头畸形、进行性、癫痫发作以及脑和小脑萎缩疾病相关;而NM_005051.3:intron14:c.1295+2_1295+4del这个变异影响到了经典剪接位点,所以,需要对该变异是否影响剪接进行再次判断;原创 2025-05-15 15:21:02 · 2075 阅读 · 0 评论 -
临床基因测序数据解读技巧-手把手教你如何通过IGV图判断串联重复
串联重复:重复序列以串联方式排列,即一个序列紧接着另一个相同的序列。例如,一个基因的外显子序列正常情况下为【ATGCGT】,如果发生了串联重复,可能变为【ATGCGTATGCGT】。判断方法:通过将变异后的基因序列与正常基因序列进行比对。如果发现重复的外显子序列是连续排列的,且重复单元之间没有间隔序列,就可以判断为串联重复。例如,使用生物信息学软件IGV展示序列比对结果,会有助于判断重复单元的排列方式。原创 2025-05-14 17:56:59 · 1310 阅读 · 0 评论
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