6、热图与树状图的绘制与应用

热图与树状图的绘制与应用

1. 聚类与可视化简介

聚类技术主要分为 K 均值聚类和层次聚类。树状图是层次聚类的一部分，它是一种类似树的结构，在我们事先不知道聚类数量时，可用于数据的可视化。聚类在生物学（研究基因组数据）、金融（研究外汇市场、股票、指数中的不同行业等的聚类情况）和经济学（研究不同城市的犯罪情况和国际贸易）等领域都有广泛应用。

2. 构建简单树状图

• 原理 ：聚类的核心思想是检测具有相似性的数据组，将数据划分为具有共同特征的不同组。树状图能帮助我们更准确地研究各种聚类的形成，通过在不同高度切割树结构，可以区分具有不同特征的聚类。
• 操作步骤 ：
  1. 准备数据 ：

set.seed(5)
x = rnorm(10)
y = rnorm(10)
z = seq(1,10, by = 1)

2. **数据处理**：

mtx = data.frame(cbind(x,y,z))
d = dist(mtx, method = "euclidean")
clust = hclust(d, "ave")

3. **绘制图形**：