ggplot-RNA文库reads比对情况-饼图[pie chart]展示

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于 2022-06-16 23:28:52 发布 · 186 阅读

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#r语言

该博客介绍了如何使用R语言批量绘制RNA文库的reads比对情况饼图。内容包括数据预处理、图样式处理及通过循环绘制多个饼图的方法。数据集包含每个文库的比对信息，博主详细阐述了数据格式转换、饼图分组变量的设定以及计算极坐标数据的步骤，并提供了两种图样式。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

任务目标：批量绘制每个RNA文库reads比对情况的饼图；
任务流程: 数据预处理和图样式处理 + 循环出图

library(RColorBrewer);library(ggforce);set.seed(123);;library(ggplot2);library(dplyr);library(tidyverse)

###数据集概况

加载进来的的数据集是按行记录了每个文库的reads比对信息，其中比对类别存在列向量，绘图注意数据格式转换，绘制一个文库的饼图需要提取数据集的一行来进行处理。
###数据处理脚本

第一步，绘图数据格式转换

data.set <- read.table("*.tsv") #加载数据集
df <- data.set[1,] #提取数据集的一行进行脚本测试
df %>% data.frame() %>% t() %>% data.frame() %>% tibble::rownames_to_column(var = "group") %>% filter_all( any_vars(grepl("Reads", .)) ) %>% 
    dplyr::rename(labels_1 = 2) %>% filter(!grepl("Mapped.to.Genome", group)) %>% 
    mutate(perc = as.numeric(sub("%", "", labels_1))/100) %>%
    mutate(labels = scales: