Day1:寻找目标文献和目标期刊
GBD数据库大有可为,大家也都比较熟悉了——四大刊及其子刊的常客,虽然现在有“颓废”之势。前期我们挑战成功了数期,最近也更新了GBD数据库的第二部分--GBD数据库中的数据分析
主要包括的分析内容包括:APC、分解分析、前沿分析、ARIMA预测未来、BAPC预测未来、EAPC
当然还有其他复杂的分析方法,但是这些对于我们发文章已经足够了。在我们看文献的过程中,发现某个疾病适当的人+适当的描述+上述分析的一种或者几种就是一篇文章,那我们就再尝试挑战一期。
有的师弟师妹很纠结说现在类似于GBD这种公开数据库不好发文章了,其实公开数据库的挖掘无止境。就好像说以前的SEER数据库一样,都过去多少年了,依旧可以发文章。MIMIC数据库一更新就涌现了很多文章,GBD一样的道理。只有不断的思考才会有idea,只有不断的思考才有突破。这次挑战的是预测,主要就是使用ARIMA和BAPC进行未来预测,这两种预测BAPC又使用更多一些。主要的代码前期已经准备好了,操作比较简单
第一天的主要任务是确定目标文献和确定目标期刊
这就需要敏锐的科研的洞察力,这就需要长时间的深度思考。
我去初略的检索了GBD and Bayesian age-period-cohort,发现了很多和我的研究类似的文章,最后终于确定给了方向。同样的最终选择了一个相对来小众的疾病,这样就不容易撞车
“XXXX发病率的全球时间趋势和预测:2021 年年龄-时期-队列分析”。经过检索和比较,最终将Q1 的Journal of global health杂志作为我的目标期刊
选择的文献是 DOI: 10.7189/jogh.14.04105——一篇关于HIV和其他性传播疾病的预测文章。
我们将使用更新后的2021年数据进行分析,争取能挑战成功。
全力以赴,冲锋冲锋!
Day 2-3:充分评估选题可行性+代码等方法学评估
今日的主要任务是在前面的基础上深入的评估可行性。我们之前就一致强调选题的重要性,一定要花大量时间去评估,不要是在做无用功。主要是根据目标文献中的核心图片和Figure,评估如果换了一个数据集过后能不能实现。看起来是换了一个数据集,但是叶不要想的过于简单,这一步需要十分的谨慎,一定要多看、多检索,和我们做MIMIC、PIC、NHANES一样,基本是选好了就能做、选不好就凉凉,不要做浪费时间的事情
方法学的内容是最简单的、也是最容易学会的。那从哪里去学习核心的方法学,其中对于目标文献的精读就显得尤其重要。
通过阅读目标文献我们发现,主要的分析包括以下方面:
--描述
--Joinpoint
--地图
--BAPC预测
搞清楚了方法学也就知道自己应该重点关注什么,也就能够跑出文章中的重要图片和表格,也就是核心Results。后面再利用框架写作法进行写作就显得十分的容易和得心应手!
挑战继续!
Day 4-5:方法学的复刻:完成核心Table和Figure
这两天的任务主要是根据研究目的下载数据+数据分析
前面有师弟再我们评论下面说:最近数据下载怎么这么慢?那是因为使用GBD的人逐渐多了起来,和我们之前跑MR的时候一样,502的情况很多,网站压力太大,也就意味着我们再下载的时候会等待很久的时间,特别是想要下载全球数据的时候。如果是这样的话,建议大家分段下载然后进行拼接——比如下载90年到21年。我每5年为一个周期进行下载,虽然有些麻烦。也只有通过这种方式一定程度上缓解压力了。但是下载的数据是标准化的,不需要过于复杂的处理就能够直接使用。一般我们需要下载发病率、患病率、DALYs
从这3个指标进行疾病负担分析,因为数据是标准化的,所以不用清洗就能直接使用,纳入到相关模型中进行展示。我们的基础代码包已经整理好了,放进代码里面跑一边就能跑出自己的结果。
基本对设备的要求一般,除非是进行前沿分析这个最好用配置好一些的电脑,其他的实现还是比较容易的。
通过不断变换研究的视角和方法——也就是换研究人群、换研究地区、换年龄范围、换危险因素,就可以持续产出新的研究成果。
今天的所有表格和图片就完成了,明天就要开始写作啦!
Day 6-7:写作+投稿前准备
结合我们之前的准备工作和跑出来的图片、表格 写作是最简单的事情。这个时候目标期刊的作用再一次体现出来:针对目标期刊进行模仿写作,模仿写作逻辑但是不能抄袭。模仿是模仿、抄袭是抄袭,一篇文章也就几千字,只要我的写作逻辑符合目标期刊。我的核心结果也有意义,那这篇文章就不会差到哪里去。
其实当我们确定了选题过后就开始写作了。写作我们的材料和方法学部分,和任何公开数据库一样的Meta、nhanes同样的,因为所有的方法学都是类似的。我首先利用“框架写作法”完成内容初稿写作,然后根据目标期刊和实际情况进行修订,然后进行文章的翻译、润色、投稿准备。投稿前准备就是按照目标期刊的要求整理相关的材料,然后就是等待老板审核内容、以及根据他的意见进行修改。
目标期刊--选题--下载数据--分析数据--框架写作--投稿准备--等待老板返修--正式投稿
这就是我们创作一篇SCI的全过程。写文章\做科研需要靠时间来泡,努力在上班\上学中抽出时间完成自己的任务,代码多跑跑、文章多写写。不要害怕写得一坨shit,“论文是改出来的”!
总之,GBD文章的思路简单而且清晰,方法学相对来说比较简单、复刻容易,希望大家都能中稿高分文章!
有一些师弟师妹经常私信询问我GBD等相关数据库挖掘的情况,我们拥有一整套行选题到投稿的高效、快速产出成果、发表文章的方案,欢迎私戳!
让我们一起努力,向前冲锋!