MATLAB加速技巧

从MATLAB平替到CUDA加速:一份给工程师的Eigen3实战技巧合集 本文为工程师提供Eigen3实战技巧合集,涵盖从MATLAB平替到CUDA加速的全流程优化。重点解析MATLAB到Eigen的语法转换、大规模稀疏系统求解策略及硬件加速集成方法,帮助开发者高效实现数值计算性能提升。通过API文档精要解读和实战案例,掌握Eigen3在多线程并行与GPU加速中的核心应用。 阅读详情

1. 向量化

目的:减少for循环的使用

`
%nonVecl.m
clear all;
tic

A=0:0.000001:10;
B=0:0.000001:10;

Z=zeros(size(A));
y=0;
for i=1:10000001
    Z(i)=sin(0.5*A(i))*exp(B(i)^2);
    y=y+Z(i);
end
toc
y
`

nonVecl.m文件使用的是for循环求和。
下面是具有相同功能的Vecl.m文件:
%Vecl.m

clear all;
tic

A=0:0.000001:10;
B=0:0.000001:10;

Z=zeros(size(A));
y=0;

y=sin(0.5*A)*exp(B.^2)';

toc
y

计算结果

2.上下边界提取

当对每个元素设定上下边界时,用min和max代替if和elseif ,防止向量化被破坏。
% ifExample.m

clear all;
tic;

A=0:0.000001:10;
B=0:0.000001:10;

Z=zeros(size(A));
y=0;

for i=1:10000001

    if(A(i)<0.1) A(i)=0.1;
    elseif (A(i)>0.9) A(i)=0.9;
    end

    Z(i)=sin(0.5*A(i))*exp(B(i)^2);
    y=y+Z(i);    
end
toc
y

用min和max代替if(A<0.1)和if(A>0.9)

%nonifExample.m

clear all;
tic

A=0:0.000001:10;
B=0:0.000001:10;

Z=zeros(size(A));
y=0;

A=max(A,0.1);
%max(A,LowerBound)
%A>=LowerBound

A=min(A,0.9);
%min(A,UpperBound)
%A>=UpperBound

y=sin(0.5*A)*exp(B.^2)';

toc
y

加速结果如下:
这里写图片描述

用find代替if(A==0.5):

if(A(i)==0.5) A(i)=0;
end

find加速:

A(find(A==0.5))=0;

3.内存预分配

调整数组大小都涉及到内存的释放或分配、数值的复制,极浪费时间。可以通过预分配内存获得加速。

%preAlloc.m
%Resizing Array

tic

x=8;
x(2)=10;
x(3)=11;
x(4)=20;

toc

%pre-allocation
tic

y=zeros(4,1);
y(1)=8;
x(2)=10;
x(3)=11;
x(4)=20;

toc

实验结果:
这里写图片描述

4.列循环嵌套

不可避免的for-loop循环,优先用列循环嵌套
行读取:

%row_first.m

clear all;

A=rand(300,300,40,40);
B=zeros(300,300,40,40);

tic
for i=1:300
    for j=1:300
        B(i,j,:,:)=2.5*A(i,j,:,:);
    end
end
toc

列读取:

%col_first.m

clear all;

A=rand(300,300,40,40);
B=zeros(300,300,40,40);

tic
for j=1:300
    for i=1:300
        B(i,j,:,:)=2.5*A(i,j,:,:);
    end
end
toc

结果:
这里写图片描述
分析:可能跟列存储机制有关,同列数据在相邻的地址。

5.稀疏矩阵

对于数据稀疏的矩阵,矩阵类型转化为稀疏矩阵,矩阵越稀疏效率越高。密集矩阵转化为稀疏矩阵运算需要花费更多的时间。
密集矩阵:

%DenseSparse.m
%Dense matrix
A=rand(5000,2000);
b=rand(5000,1);

tic
x=A\b;
toc

%Convert to sparse form in MATLAB
sp_denseA=sparse(A);

tic 
x=sp_denseA\b;
toc

稀疏矩阵:

%RealSparse.m
%Sparse matrix
sp_A2=sprand(5000,2000,0.2);
b2=rand(5000,1);

%Convert sparse matrix to full matrix
full_A2=full(sp_A2);

tic
y=full_A2\b2;
toc

tic
y=sp_A2\b2;
toc

运算结果:
这里写图片描述
对于密集的矩阵,用密集矩阵运算更快,用稀疏矩阵反而慢;对于稀疏的矩阵,用稀疏矩阵运算更快。

6.减少文件读写、设置路径和改变变量类型

文件读写、设置路径、改变变量类型需要花费大量的时间,在循环中,最好放在循环之外

CPLEX在MATLAB中的隐藏技巧:用YALMIP实现大规模整数规划加速 本文深入探讨了如何利用YALMIP在MATLAB中优化CPLEX的大规模整数规划求解性能。通过稀疏矩阵处理、并行计算调优和精准参数设置,显著降低内存占用并加速求解过程,特别适用于超过1万个变量的复杂问题。实战案例显示,优化后求解时间减少72%,内存消耗降低72%。 阅读详情

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1. 向量化目的:减少for循环的使用`%nonVecl.mclear all;ticA=0:0.000001:10;B=0:0.000001:10;Z=zeros(size(A));y=0;for i=1:10000001Z(i)=sin(0.5*A(i))*exp(B(i)^2);y=y+Z(i);endtocy`nonVecl.m文件使用的是for循环求和。下面是具有相同功能的Vecl.m文...

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