科学智能AI for Science时代:药企如何把握数据驱动的新机遇?

AI全景之第十二章第四节:AI for Science AGI的竞赛已不仅是算力的比拼,更是对智能本质理解的深化和技术路线多样性的探索。这是一场需要耐心、智慧和协作的漫长旅程,而每一步突破,都将在智能制造、科学发现、医疗健康等领域迸发出变革性的力量。 阅读详情

随着科学智能(AI for Science) 、人工智能等技术的发展,我们进入了一个数据智能分级时代。一方面,大数据、人工智能等技术为企业提供了丰富的数据资源,助力企业实现研发模式的转型升级;另一方面,如何通过数据智能分级有效利用这些数据,成为企业赢得市场竞争的关键。创腾科技自主研发的SDH科学数据基因组平台,作为一款强大的可视化数据分析BI工具为药物研发领域提供了全面、高效的数据解决方案,助力企业快速把握数据驱动的新机遇。

SDH科学数据基因组平台以国产软件为基础,整合了生物信息学、人工智能和大数据技术,为药物研发提供了一套全面、高效的数据支持。作为一款国产软件,SDH平台在设计之初就充分考虑了我国药研行业的实际需求,以“国产化、自主可控”为研发目标,从根本上解决了国外软件在我国药研领域的应用难题。SDH可以帮助企业从海量数据中提取有用信息,是一款优秀的可视化数据分析BI工具,可以辅助决策。随着大数据时代的到来,科学数据基因组平台将成为越来越多企业的必备工具。

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一、数据连接

利用SDH平台,通过一系列的标准化技术,各种不同格式的实验数据,如内部数据库,Excel文档或任何从科研中获得的数据组织成统一有序的信息,为决策提供有力依据;利用平台灵活的数据和程序整合能力把电子实验记录本系统ELN、项目管理系统PM和化合物管理系统CMS等不同的管理系统有机的连接起来,起到信息的汇集、整理和共享的平台服务作用。帮助用户更好的规划和执行实验,并构建信息化系统来分析和管理产品设计研发。

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SDH药物科研数据库

通过SDH科学数据基因组,科研人员可以方便连接到药物科研数据库ChEMBL、BindingDB、UNPD、DTPDS中,极大提高了药物研发效率。

1、ChEMBL

ChEMBL是一个药物发现数据库,旨在药物研究和开发过程中获得药物化学相关数据和信息,其包含药物分子,活性实验测试,靶点和文献等相关信息。该数据库收集了230万个不同化合物,15,072个靶点。2000个不同的细胞系和757个组织/器官等。其中小分子及其生物活性信息是从主要的药物化学杂志的文章中获取,并与已批准药物和临床开发候选药物的数据相结合,如作用机制和治疗适应症。生物活性数据也与其他数据库相关联。该数据库具有泛的应用,包括对感兴趣的靶点标记的化学工具,训练机器学习模型,评估化合物选择性等。

2、BindingDB

BindingDB主要聚焦于药物靶点蛋白质和类药小分子之间相互作用的数据库”助力药物发现、药理学和相关领域的研究。本数据库收集了110万个化合物,8,965个靶点以及263万条化合物和靶点相互作用的数据。收集的数据来自各种测量技术,包括酶抑制法,动力学测试,等温滴定量热法,核磁共振和放射性配体竞争分析法。BindingDB数据库中的数据通常包含了更多实验条件的细节信息。

3、UNPD

全球天然产物数据库(UNPD)是由北京大学徐筱杰教授带领建立的中药相关数据库,助力于系统的阐明中药的作用机理及中医药的科学内涵,也为中药开发提供新的思路。

全球天然产物数据库系统包括方剂、中药材、植物、分子、疾病、临床指标等,收集了经典中药方、证候、中药材植物及其包含的化合物、临床标志物和相关通路、FDA批准的药的蛋白质靶点和(均有复合物晶体结构或NMR结构) 以及化合物与药靶的分子对接数据、相关疾病和已有实验数据报道的化合物与蛋白质的相互作用数据。

4、DTPDS

通过药物作用网络数据库可以方便的获得、分析和更准确的研究药物、靶标、通路、疾病及其症状之间的作用关系,找到潜在的药物、靶标及其作用机制,研究更有效的药物。数据主要来自DrugBank、UniProt、KEGG和OMIM等数据库。

本数据库收录了11355个药物、与药物有相互作用的5095个人类蛋白、537条相关生物通路、1949种相关疾病和26257种疾病症状。同时还收录了各个种类之间的相互作用关系(比如药物和蛋白的关系等)。相关数据分别从Drugbank、UniProt、KEGG和OMIM数据库取得。所有药物和蛋白的相互作用关系都是有文献报导且大部分是经过实验证实的,其他相互作用关系包括蛋白-通路、通路-疾病和疾病-症状等。

二、数据信息梳理

通过平台中内容视图和数据基因组功能模块,实现将研发和生产过程中来自不同业务系统、专业数据库等数据源的海量跨源异构科学数据进行整合和分析,帮助用户捕捉和获取核心科学资料和数据;锚点连接、拖拽操作等,降低系统使用门槛;树状脑图与旭日图-双视图,从不同视角构建与管理数据基因组,轻松实现科研业务数据融合与溯源,科学管理和使用研发和生产过程中的数据资产。

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三、智能化的分析工具

SDH平台融合了人工智能技术,具备自主学习、深度挖掘的能力。在平台的使用过程中,可以不断优化算法,提高分析准确性,为药物研发提供更加智能、便捷的分析工具。同时考虑到不同用户的需求,提供了丰富的模块和工具,用户可根据实际需求进行高度定制。无论是基因注释、药物筛选或者蛋白表达条件和表达数量和表达质量的场景,SDH平台都能为用户提供专业、个性化的解决方案。

SDH支持科学业务数据融合,包括结构式、生物序列和图谱等,并可以进行各类描述符的计算,同时也支持结构的精确检索和子结构的模糊检索,方便用户针对结构信息进行筛选定位。在过程控制研究中,可自定义选取关键工艺参数构建控制图,包括单值和移动极差控制图(I-MR 控制图),均值和极差控制图(XBar-R Charts),均值和标准差控制图(XBar-S Charts),走势图(Run Charts),图表分析采用Western Electric 规则,提供八大特殊原因检验。

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四、数据安全与隐私保护

SDH平台重视客户数据的安全性和隐私保护,引入空间的概念对数据进行分权限隔离,采用严格的安全策略和加密技术。客户可以在使用过程中确保数据安全,无需担忧潜在的信息泄露风险。

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在数据智能分级时代,创腾科技SDH科学数据基因组平台为企业提供了强大的数据驱动能力。借助这一国产优质产品,企业不仅可以克服数据孤岛现象、提高数据质量,凭借可视化数据分析BI报表还能实现高效的数据挖掘和分析。让我们一起迈向数据驱动的药物研发新时代,为全球患者带来更多优质的创新药物,助力我国药研事业迈向新高峰!

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