生物学研究必备！FASTA（Fast-All）在云峦操作系统配置指南

目录

1 概述

2 安装环境

2.1 操作系统环境

2.2 工具版本

3 安装与测试

3.1 安装FASTA

3.2 使用测试

---

1 概述

浪潮信息KOS是浪潮信息基于Linux Kernel、OpenAnolis等开源技术自主研发的一款服务器操作系统，支持x86、ARM等主流架构处理器，性能和稳定性居于行业领先地位，具备成熟的 CentOS 迁移和替换能力，可满足云计算、大数据、分布式存储、人工智能、边缘计算等应用场景需求。详细介绍见官网浪潮信息云峦服务器操作系统KeyarchOS_KOS服务器操作系统-浪潮信息

FASTA（Fast-All）是一套用于比对生物学序列的软件工具，最初由 William R. Pearson 和 David J. Lipman 在 1988 年首次发布。FASTA 旨在快速搜索序列数据库以寻找与给定查询序列相似的序列。FASTA 的核心原理是通过计算序列之间的局部相似性来找到匹配。它使用散列和滑动窗口技术来识别相似的、非连续的子序列。FASTA 被广泛应用于生物信息学领域，用于比对蛋白质序列和核酸序列。基本用法涉及提供一个查询序列，然后搜索一个或多个目标数据库，找到相似的序列。提供了多种参数和算法选项，允许用户根据实际需求进行调整。其输出通常包含相似性得分、匹配的位置以及其他统计信息。详细介绍见官网链接https://fasta.bioch.virginia.edu/。

2 安装环境