近红外光谱建模之区间偏最小二乘法python实现(ipls算法)

目录

 

1 区间偏最小二乘法原理(ipls)

2 ipls的python实现

3 实验结果图


 1 区间偏最小二乘法原理(ipls)

区间偏最小二乘法可以用来提取特征波段,它将整个光谱区域划分为多个等宽的子区间, 假设为n个; 在每个子区间上进行偏最小二乘回归,建立待测品质的"局部回归模型",也就是可以得到n个局部回归模型;以均方根无误差MSE值为各模型的精度衡量标准,取精度最高的局部模型所在的子区间为特征波段。

2 ipls的python实现

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from utility_spectrum import spxy, ipls
import scipy.io as sio
from sklearn.cross_decomposition import PLSRegression
from sklearn.metrics import mean_squared_error


def splitspectrum(interval_num, x_train, x_test):
    """
    :param interval_num:  int (common values are 10, 20, 30 or 40)
    :param x_train:  shape (n_samples, n_features)
    :param x_test:  shape (n_samples, n_features)
  
<think>嗯,用户想了解近红外光谱波段选择中的相关系数法,包括算法原理和实现方法。首先,我需要回忆一下相关系数法在特征选择中的应用。相关系数通常用来衡量两个变量之间的线性相关程度,这在统计学里是基础概念,比如皮尔逊相关系数。 根据用户提供的引用内容,特别是引用[3]中提到变量选择准则分为基于波长信息容量和基于模型性能的统计两类。相关系数法应该属于后者,因为它可能通过统计指标(如R²、RMSE等)来评估波段的相关性。不过,具体到相关系数法,可能是指直接计算每个波长与目标性质(比如浓度)的相关系数,选择相关性高的波段。 接下来,算法原理部分。需要说明相关系数如何量化波长与目标变量的线性关系,强调皮尔逊相关系数的计算公式,以及如何根据阈值或排名选择特征。可能还需要提到这种方法属于单变量特征选择,忽略了变量间的相互作用,但计算简单高效。 实现方法的话,步骤应该是:数据准备,计算相关系数,排序或阈值筛选,建模验证。这里可能需要用Python代码示例,比如用numpy计算相关系数,然后选择Top N的波段。需要注意的是,引用[2]提到特征选择和特征提取的区别,这里明确是特征选择,即保留原始波长而不是变换。 另外,用户提供的引用中有提到PLS(引用[1])和优化算法(引用[3]),可能需要对比说明相关系数法与其他方法(如iPLS、GA等)的优缺点,比如计算简单但可能忽略共线性问题。最后,生成的相关问题要围绕该方法的应用、对比、优化以及与其他方法的结合,比如与PLS结合使用是否有效。 需要确保回答结构清晰,分点说明原理和实现,代码部分用正确格式,并正确引用提供的资料。可能还需要检查是否有其他相关方法被遗漏,但用户特别询问相关系数法,所以应聚焦于此。最后的问题生成要引导用户深入思考该方法的实际应用和限制。</think>### 近红外光谱波段选择的相关系数法 #### 一、算法原理 相关系数法是一种基于变量与目标性质(如浓度、成分含量)线性相关性的**单变量特征选择方法**。其核心是通过计算每个波长点光谱数据与目标变量的皮尔逊相关系数(Pearson correlation coefficient),筛选出相关性强的波段用于建模[^2]。 数学原理可表示为: $$ r_x = \frac{\sum_{i=1}^n (x_i - \bar{x})(y_i - \bar{y})}{\sqrt{\sum_{i=1}^n (x_i - \bar{x})^2} \cdot \sqrt{\sum_{i=1}^n (y_i - \bar{y})^2}} $$ 其中$x_i$为某波长点的光谱强度,$y_i$为目标变量,$\bar{x}$和$\bar{y}$为均值。**$|r_x|$越接近1,表示该波长与目标变量线性相关性越强**。 #### 二、实现方法 1. **数据准备** - 获取近红外光谱矩阵$X_{n \times p}$($n$样本数,$p$波长点数)和目标变量向量$y_{n \times 1}$ - 标准化光谱数据(消除基线漂移影响) 2. **计算相关系数** 对每个波长点$j$计算其与$y$的$r_j$值,形成相关系数向量$R_{1 \times p}$。 3. **波段筛选** - **阈值法**:选择$|r_j| > \theta$的波长($\theta$需根据实验确定) - **排序法**:按$|r_j|$降序排列,选取Top-$k$个波长 4. **建模验证** 使用筛选后的波长建立PLS或线性回归模型,通过交叉验证评估性能(如RMSE、R²)[^3]。 #### 三、Python代码示例 ```python import numpy as np from sklearn.cross_decomposition import PLSRegression # 计算相关系数 X = np.random.rand(100, 500) # 100样本,500波长 y = np.random.rand(100) corr_coefs = np.array([np.corrcoef(X[:, i], y)[0, 1] for i in range(X.shape[1])]) # 选择Top-50波长 selected_idx = np.argsort(np.abs(corr_coefs))[-50:] X_selected = X[:, selected_idx] # PLS建模验证 pls = PLSRegression(n_components=3) pls.fit(X_selected, y) ``` #### 四、方法特点 | 优点 | 局限性 | |------|--------| | 计算效率高($O(np)$复杂度) | 忽略波长间交互作用 | | 物理意义明确(直接关联目标变量) | 无法处理非线性关系 | | 适合高维数据初筛[^1] | 可能遗漏共线性重要波长 |
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