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RSS订阅原创 安装R包arrow
原因是老版本的openSSL会有EVP_MD_CTX_destroy，但新版本的openSSL中，EVP_MD_CTX_destroy改为了EVP_MD_CTX_free。手动安装过程一直使用的更新版的openSSL，不知道为何，安装R包arrow的过程中，它会找到并使用老版本的openSSL。注意，这里的很多选择是预设安装选项ninja-release-python的。R包arrow依赖于cpp的libarrow，需安装。如果没有已经装好的libarrow，R包arrow过程中会自己获取并安装。
2025-02-18 10:27:01
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原创 一个奇怪的软件编译错误
进入发生错误的目录(ext/-test-/cxxanyargs)，命令`ls`第一次没有显示Makefile以及某个头文件。但第二次执行命令`ls`后Makefile等文件出现了。然后可以继续make ......在另一个集群编译安装软件，频繁出现的一个问题是，configure 后出现不存在的，名为idle的文件，从而阻止编译过程。在该目录下通过rsync 复制另一个不相关的文件，如。会发现文件idle消失了。然后可以继续make ......文件存放目录为系统为集群上挂在的nfs4存储。
2025-01-07 20:46:41
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原创 源代码编译安装X11及相关库、vim，配置vim（4）
这里是这次编译安装学到的教训。在新的环境，先确认系统默认的各软件是不是较新。然后一定要将各关键软件都更新到较新版本或多版本。常用软件包括gcc, git, java, perl, python, python3, R, ruby, tcltk, X11 等等。千万记住，一定更新软件！
2025-01-06 16:51:35
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原创 源代码编译安装X11及相关库、vim，配置vim（3）
注意，对与powerline插件，它需要先（或者它自己会）安装好python包powerline-status. vim会导入这个python包。如果vim编译安装和软件环境配置有冲突，可能vim里导入python包会报错，如“undefined symbol: _PyUnicode_Ready” （参见。我的情况估计是系统默认的老版本python2干扰了。我的解决方法是，重新编译安装较新的python2和python3，然后编译vim时都指定要python2和python3的支持（见上篇）。
2025-01-06 16:34:52
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原创 源代码编译安装X11及相关库、vim，配置vim（2）
编译时的cofigure选项如下.只有上一步的X11的包安装全了（具体哪些是必须的，哪些是多余的没验证），configure才能认为X的库文件和头文件是可以用的。
2025-01-04 11:44:39
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原创 源代码编译安装X11及相关库、vim，配置vim（1）
所有X11及相关库装到mybuild，源代码下载到src下，解压，进入，编译安装。编译时指定--prefix到相同的目录，即上图中mybuild。手动编译各X11库相关的包，如下表。
2025-01-04 11:30:16
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原创 slurm 有节点一直是down*状态
gres.conf 文件（/opt/slurm/etc/gres.conf）里表明该节点有个tesla的GPU卡，它引用了/dev/nvidia0文件。4. 神奇的是，执行完这个nvidia-smi后，/dev/里有nvidia0了。NodeName=节点名 Type=tesla Name=gpu File=/dev/nvidia0。在该节点ls /dev 确实是没有看到/dev/nvidia0文件。3. 在该节点执行以下命令后，确实是显示了GPU卡的信息。2. 登录有问题节点后，
2024-02-01 17:26:41
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原创 配置RStudio server和shiny server 以指定LD_LIBRARY_PATH
【代码】配置RStudio和shiny以指定LD_LIBRARY_PATH。
2023-05-16 17:05:13
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原创 我的R编译选项
-with-tcl-config=/路径到/tcltk/tcl8.5.19/unix/mybuild/lib/tclConfig.sh \。LDFLAGS="-L/路径到/Intel_oneAPI/mybuild/mkl/latest/lib/intel64 -l mkl_rt"--with-tk-config=/路径到/tcltk/tk8.5.19/unix/mybuild/lib/tkConfig.sh \。
2022-12-09 22:27:47
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原创 R编译带tcltk选项及安装R包gWidgets2tcltk
需要将putty的“Enable X11 forwarding"打开，运行Xming，再用putty登录服务器，重新安装gWidgets2tcltk。2. 安装R包gWidgets2tcltk。该包依赖于软件tcktk（
2022-12-09 22:24:53
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1原创 using jupyter
0. install python and jupyterIn my ~/.bashrc, I have:. /tools/software/Modules/modules-4.7.1/init/profile.shexport MODULEPATH="/tools/modulefiles:/workspace/japrin/05.setting/modulefiles":$MODULEPATHmodule purgemodule load python/3.9.51. gener
2022-02-10 09:56:48
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原创 安装harfbuzz遇到的报错与解决方法
重新安装ggrastr,需要先安装harfbuzz。0）报错： ./autogen.sh 出现undefined symbol: Perl_xs_handshake解决方法： 重装 autoconf （automake， libtool）1）报错： 0)解决后， ./autogen.sh 又出现src/hb-ucdn/Makefile.am:3: error: Libtool library used but 'LIBTOOL' is undefinedsrc/hb-ucdn/M.
2020-10-30 18:36:19
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原创 Cannot build gcc-6.4.0: fenv_t has not been declared
solutionadd this option to./configure:--disable-libstdcxx-pch
2020-02-06 17:26:23
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原创 st_tissue_recognition安装
1. openCV装4.0.1.openCV 4.0.1有个小布丁（https://github.com/opencv/opencv/pull/13969/files）要根据它修改下：modules/videoio/src/cap_v4l.cpp 的245行后加上：// https://github.com/opencv/opencv/issues/13929#ifndef V4L...
2019-03-23 23:14:55
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原创 Error: modulecmd: malloc(): memory corruption: memory corruption
出现error：modulecmd: malloc(): memory corruption: memory corruption检查发现是modulecmd的版本不对在没问题的节点上是3.2.10，并且/usr/bin/modulecmd --> /usr/local/Modules/3.2.10/bin/modulecmd而在有问题的节点上是3.2.7,/u...
2018-08-06 11:03:44
1115
原创 安装R包
报错：configure: error: Need GSL version >= 1.12ERROR: configuration failed for package ‘gsl’ ...
2018-06-20 09:11:44
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原创 error related with autoconfig
Errors as follow:./configure: line 2140: AX_CHECK_ENABLE_DEBUG: command not foundchecking build system type... x86_64-unknown-linux-gnuchecking host system type... x86_64-unknown-linux-gnu./configure:...
2018-04-11 17:08:41
803
原创 Can't connect to local MySQL server through socket ...
solution: service mysqld restart
2017-02-14 10:09:54
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原创 vim笔记（1）
:mksession [file]:source session-file:wviminfo [file]:rviminfo [file]‘sessionoptions’选项和‘viminfo’选项set path=.,/usr/include,,/Share/BP/zhenglt/01.bin/vi/vim/src*.c:help starstar-wildcard
2016-12-21 20:57:43
371
原创 安装软件spams时报错error: template with C linkage
安装 spams 这个软件时报错In file included from /....../R/R-3.3.0/mybuild/lib64/R/include/R.h:43, from spams.cpp:1277:/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.6/../../../../include/c++/4.4.6/c
2016-07-28 22:12:52
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原创 网络带宽查看并找出占用大的进程
1)iftop -i eth1 找到网卡eth1上占带宽大的端口号；2)lsof -i :55775 找到监听端口号55775的进程3)/proc/21879/目录下是进程号为21879的进展的信息文件，如/proc/21879/cmdline是执行的命令行
2016-07-26 09:41:30
3191
原创 ssh自动认证
以下是步骤：在$HOME/.ssh下 ssh-keygen -t rsa -f id_rsa 这将生成密钥对 id_rsa, id_rsa.pub将id_rsa.pub上传到集群$HOME/.ssh将id_rsa.pub的内容追加到authorized_keys cat id_rsa.pub>> authorized_keys
2016-07-26 08:18:17
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原创 安装graphviz
git 最新版graphviz，autogen.sh报错configure.ac:33: error: possibly undefined macro: AC_SUBST If this token and others are legitimate, please use m4_pattern_allow. See the Autoconf document
2016-06-17 23:38:40
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原创 how to use cmake
1. cmake 的几个变量：CMAKE_INSTALL_PREFIX, CMAKE_CXX_FLAGS, CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS /PROJ/GR/share/Software/cmake/current/bin/cmake ../ -DCMAKE_BUILD_TYPE=release -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../mybin/ -DCMAKE
2016-06-13 10:44:45
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原创 CFileDialog多选文件问题
CFileDialog多选文件 受到m_ofn.nMaxFile（缓冲区的大小）和lpstrFile（存放文件名的缓冲区）的限制。默认情况下，CFileDialog的m_ofn.nMaxFile是260；开始改：TCHAR *pBuffer=new TCHAR[MAX_PATH*100]; m_ofn.lpstrFile=pBuffer; m_ofn.nMaxFile=MAX_PA
2008-01-27 20:41:00
1893
原创 声卡问题记
昨天第一次戴上耳机，自买这个新电脑以来。没想到竟播放不了！没有音频设备！！！马上再装一次声卡驱动程序。可我记得，电脑城装机回来又重装系统时把所有的驱动都装过了的呀。再装一次，都没用！设备管理器－声音、视频和游戏控制器里，都有传统音频驱动程序，音频编码解码器等。只能在网上搜下。搜了半天，无非是说装声卡驱动。可我装了N次，重启N次，还到BIOS里查看了，都不行。我确定不会是硬件方面的问题。因为从电脑城
2007-12-09 09:23:00
1318
原创 初次使用Gdi+
今天第一次使用Gdi plus（VC6下），想显示一张图像。折腾 了半天，就是显示不出来。在网上找了一些相关帖子，难道Gdi+没初始化？不可能啊。仔细检查，没问题。图像有问题？也不可能吧……但还是试试换了张图像。竟然显示出来了！！真是图像问题？检查下。晕呢！原来是文件名搞错了！！文件名本来是要命名为“01.jpg”的。但一不小心命名为“01..jpg”了！而在程序中仍是“01.jpg”！！！
2007-12-04 11:43:00
489
空空如也
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