导入conda虚拟环境的lib

解决Conda环境中scipy导入错误：GLIBCXX版本问题,

最新推荐文章于 2025-05-12 21:03:18 发布

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#conda #LD_LIBRARY_PATH #shell #python #libstdc++

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文章讲述了在使用conda虚拟环境运行代码时遇到的scipy导入错误，原因是GLIBCXX版本不兼容。解决方法是在.bashrc文件中添加conda环境的lib目录到LD_LIBRARY_PATH，以便系统能找到所需的库。

用 conda 虚拟环境跑代码，import scipy 时报错：

ImportError: /lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29' not found (required by /data/itom/miniconda3/envs/cu116_pt1131/lib/python3.9/site-packages/scipy/spatial/_ckdtree.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so)

参考 [1]，一种解法是把所用的 conda 虚拟环境的 lib/ 加入到 LD_LIBRARY_PATH。为自动导入，可在 ~/.bashrc 中加入：

假设 miniconda3 的安装路径是 ~/miniconda3/

# ~/.bashrc 内
if [ -d $HOME/miniconda3/envs ]; then
	ld_lib_path=""
	for d in `ls $HOME/miniconda3/envs`; do
		if [ -z $ld_lib_path ]; then
			ld_lib_path=$HOME/miniconda3/envs/$d/lib
		else
			ld_lib_path=$ld_lib_path:$$HOME/miniconda3/envs/$d/lib
		fi
	done
	if [ ! -z $ld_lib_path ]; then
		if [ -z $LD_LIBRARY_PATH ]; then
			export LD_LIBRARY_PATH=$ld_lib_path
		else
			export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$ld_lib_path
		fi
	fi
fi

References

Anaconda ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21’ not found
ImportError: /lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29’ not found #11417
ImportError: `GLIBCXX_3.4.30’ not found #1282