ENMTools去除相关性过高的环境因子

最新推荐文章于 2025-05-21 14:47:19 发布
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参考这个视频MaxEnt-6-使用相关性分析以及贡献度对环境因子进一步筛选

首先设置ENMTools的各种配置，output diretory选择的是输出的文件夹，需要记清楚

另外ENMTools工具涉及到的文件夹都是用纯英文，且不要过长，以免产生问题

使用Correlation工具

这里需要强调的是，选择的asc不是原始的环境数据，而是按照物种点位数据提取后的数据，提取步骤可参考我的另一篇文章arcgis批量掩膜提取

ENMTools的运行过程

下面是完成后的结果输出

如果两个环境因子间相关性的绝对值超过0.8（也有文献使用0.75或0.7），则删去贡献率低的那个。这个贡献率需要使用maxent提前进行一次建模，把所有环境因子都选上，建模后看贡献率。

ENMTools工具删除重复点位
HYQ811026433的博客
03-07 416
物种分布数据往往有很多点位，这些点位可能是重复的，需要删除以消除过拟合。如果是删除完全一致的点位可以在Excel里进行，熟练使用Excel的话会很快。但是如果有ENMTools工具的话，则可以一键删除，如果有很多个物种，则Excel比较麻烦，使用ENMTools效率会很快。
maxent分布预测如何选择环境气候数据
生信小窝的博客
11-02 4080
maxent分布预测如何选择环境气候数据 在做分布预测时，选择气候数据的类型会直接影响到预测结果的合理性和准确性，不同物种要选择不同的气候数据。 例如，我们做植物的分布预测，我们要选择与植物生境分布息息相关的气候因子，其中，降雨，温度，海拔坡度，最重要的还有土壤类型，如上面截图中的土壤属性，我们都知道基本多数植物只有在合适的土壤类型中才会生长，所以土壤数据对植物的分布预测至关重要。 例如，我们做的是海洋动物，因为海洋动物基本不受降雨，土壤类型的影响，所以这类数据是不需要的，我们要根据相关的文献资料参考选择合
biomod2环境因子预处理-筛选建模环境因子
guo4032的博客
05-02 544
由于环境指标之间可能存在较强相关性,数据冗余不仅会降低运算效率,还会影响到适生区识别结果的稳定性,因此由此要对生境特征变量进行筛选。另一方面，使用MaxEnt模型对所有环境因子进行预处理，得到不同环境因子对物种地理分布的因子贡献率。一方面，对所有环境因子进行Pearson相关性分析，判断不同环境因子间是否具有相关性。以因子贡献率为基础，结合相关性分析结果，选择用于建模的环境因子。
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生信小窝的博客
12-16 2338
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利用ENVI、Maxent等软件分析制作生态环评中所需各种图件
weixin_60784949的博客
03-28 793
根据最新生态环境影响评价导则，结合生态环评内容庞杂、综合性强的特点，以既包括陆域、又包括水域的项目为主要案例，对生态环评的具体流程及所需内容进行系统阐述。利用Rstudio、Fragstats等软件分析计算生态环评中所需各种指数，利用ENVI、Maxent等软件分析制作生态环评中所需各种图件。内容包括生态环评的工作程序、生物多样性测定、生物量及净初级生产力测定、生态系统格局及服务功能评估、生物完整性指数测定、景观指数计算、生态环境状况综合指数计算；土地利用现状图的制作、植被类型图的制作、植被覆盖度图的制作、
为什么推荐 “ENMTools工具”筛选物种分 布数据而非“缓冲区法”筛选分布数据
生信小窝的博客
12-21 4103
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