1. Anaconda和RDkit介绍
Anaconda 是开源跨平台的软件包管理器,能够创建虚拟的Python执行环境,解决依赖库版本冲突的问题。
RDkit是开源的化学信息学依赖库,基于C++编写开发,提供Python的接口,在化学模拟计算方面领域被广泛使用。
使用Anaconda安装是目前最快捷的RDKit安装方式。
2. 如何安装
conda能够直接安装依赖库,或者创建虚拟环境。
# 在现有环境下安装
conda install -c conda-forge rdkit
# 创建新的环境并安装
conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit
创建虚拟环境后,需要进行激活,这样相应环境中的python解释器变成默认解释器。
conda activate my-rdkit-env
以%ANACONDA_BASE%为Anaconda的安装目录,新创建的环境my-rdkit-env在路径%ANACONDA_BASE%\envs\下,以my-rdkit-env命名的文件夹实际相当于一个Python安装目录,激活该环境后,即以该环境下的python解释器执行python代码。
本文介绍了Anaconda这一跨平台的Python包管理器,以及RDKit,一个用于化学信息学的开源库。通过Anaconda可以方便地创建和管理虚拟环境以解决依赖库冲突。详细步骤指导了如何使用conda命令安装RDKit,并创建虚拟环境,以及激活新环境的方法。新环境位于Anaconda安装目录下的envs文件夹中,激活后将使用该环境的Python解释器运行代码。
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