绘制遗传图谱工具——MapChart

最新推荐文章于 2025-05-08 18:47:38 发布

原创最新推荐文章于 2025-05-08 18:47:38 发布 · 8.6k 阅读

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#生物信息学 #r语言

本文介绍了如何使用MapChart这款遗传图谱绘制工具。通过下载、安装并按步骤操作，即可快速创建遗传图谱。在软件中输入数据并点击chart按钮，即可生成图形。MapChart的Example文件夹提供了更多样式参考，但要注意需将license文件放置正确位置以确保正常运行。虽然软件操作简便，但遗憾的是保存图片功能有限，只能借助截图工具。

建议下载百度网盘软件！

链接：https://pan.baidu.com/s/1IzbCOf1wjRMlXWNAjdsRRA?pwd=pgii
提取码：pgii

点击下载Mapcahrt，注意看安装说明！

软件操作：下载->安装->点击File->new->复制下面代码到data->点击chart->叮叮叮完成啦，试一试吧！查看Mapchart文件夹下的Example解锁更多造型

软件很好操作，下载后将license文件复制到mapchart.exe下才能更好使用；

软件使用单个字母表示设置，比如B代表字体加粗（Bold），I斜体（italic）U下划线（Underline），S（Start position）E（End position）

保存图片好像只能使用截图工具，这一点不太好。

下面是示例：复制该例子就能得到下面的连锁图

;英文分号表示注释，位于一行的前面，注释内容不会显示在图谱上,建议除汉字以外全部使用英文半角
;绘制分子标记在染色体上的物理位置（或者遗传距离）示例
chrom Chr2:Mb(N=120) S=0 E=7
;下面是分子标记，标记一定按照数字从小到大排列，可以设置标记的字体大小S数字,粗体Bold、斜体Italic、下划线Underline，颜色Color数字
InDel2-1 0.5
InDel2-2 1.5
InDel2-3 3.0
InDel2-1 4.5 BIU C2 S10
locusA 4.7 I S20
InDel2-2 5.0 BIU C2 S10
InDel2-3 6.8 
;segments为突出部分，可以填充颜色
segments
4.5 5.0 C4
;大公告成，更多功能参考Mapchart文件夹下的Example