LAMMPS体系温度分析与MATLAB计算

LAMMPS体系温度分析与MATLAB计算

在分子动力学模拟中，LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一个常用的开源软件包，用于模拟原子尺度系统的行为。其中一个重要的方面是对体系温度的分析，它可以提供有关体系热力学行为的重要信息。在本文中，我们将介绍如何使用MATLAB计算LAMMPS模拟的体系温度。

首先，我们需要从LAMMPS输出文件中提取原子的位置和速度信息。通常，LAMMPS输出文件的格式为文本文件，其中包含了每个时间步长的原子坐标、速度和其他相关信息。我们可以使用MATLAB的文件读取功能来导入这些数据。假设我们的LAMMPS输出文件名为"lammps_output.txt"，以下是导入数据的示例代码：

% 导入LAMMPS输出文件
data = importdata('lammps_output.txt')