AlphaFold2算法详解

正文：https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2

补充文件：https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-021-03819-2/MediaObjects/41586_2021_3819_MOESM1_ESM.pdfhttps://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41586-021-03819-2/MediaObjects/41586_2021_3819_MOESM1_ESM.pdf学习视频（强烈推荐）：

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1. 搜索同源序列和模板：

去按序列数据库以及PDB数据库中去搜索同源序列和模板

给定序列A，到Uniref90、MGnify、Uniclust30、BFD数据库中搜索他的同源序列，从Unire90中得到MSA。然后到PDB70中搜索同源模板得到对应的mmCif文件

1）当相似度高于50%，常推测检测序列和目标序列有可能是同源序列。

2）MSA

MSA是Multiple Sequence Alignment的缩写，即多序列对齐，这个技术用于从一个大的数据库中抽取和输入氨基酸序列相近的序列，并且顺便进行对齐。抽取这个特征的原因是类似的氨基酸序列一般来说折叠方式也类似，相当于在特征中就加入了相近的序列结