医学影像组学数据特征值介绍

影像组学特征值含义及计算验证问题
在与临床医生合作中,面临影像组学特征值含义、对应临床信息应计算的特征值及特征值验证等问题。最新的pyradiomics可计算8类共120项特征值,后文将介绍这些特征值的含义。

在和临床一线医生合作中,遇到的最大问题就是:

1.影像组学中的特征值是什么含义?

2.如何对应到临床信息,这个课题应该计算哪些特征值?

3.如何验证这些特征值是正确的?

最新的pyradiomics可以计算的特征值包括以下几类:

Radiomic Features

This section contains the definitions of the various features that can be extracted using PyRadiomics. They are subdivided into the following classes:

后文继续介绍上述这8类共120项特征值的含义。

### 影像组学特征数据的预处理方法 医学影像是一种利用高通量方法从医学影像中提取大量定量特征的技术,这些特征可以用于疾病诊断、预测和治疗评估。为了提高数据分析的有效性和准确性,在实际应用前通常需要对影像组学特征数据进行一系列预处理操作。 #### 1. 数据清洗 在获取影像组学特征之前,原始医学影像可能含有噪声或其他干扰因素。因此,第一步是对图像进行去噪和平滑化处理。常用的方法包括但不限于高斯滤波器[^1]、小波变换降噪等。此外,还需要去除异常值或离群点。例如,可以通过绝对中位差 (Median Absolute Deviation, MAD)[^3] 来识别并剔除那些显著偏离正常分布范围的特征值。 #### 2. 图像标准化 由于不同设备采集得到的医学影像是存在差异性的,所以有必要执行统一尺度下的转换过程来消除这种偏差带来的影响。具体而言,这涉及到了灰阶调整以及空间配准两个方面的工作内容。前者旨在使所有样本具有相同的亮度水平;后者则是指将来自多个视角或者时间序列上的同一位患者体内的器官结构精确对应起来以便于进一步比较分析。 #### 3. 特征选择与降维 随着现代成像技术和算法的发展进步,往往可以从一张CT/MRI扫描图里自动抽取数以千计甚至更多维度的信息向量作为候选变量参与后续统计建模环节之中 。然而如此庞大的参数集合不仅增加了计算复杂度而且容易引发过拟合现象发生 ,故而必须采取有效措施加以控制简化之即所谓“特征工程”。常见的做法有主成分分析法PCA(principal component analysis),线性判别式LDA(linear discriminantanalysis )以及其他机器习框架下实现的功能模块比如随机森林RF(Random Forests)中的重要程度排序机制等等均能起到良好作用效果 [^2]. #### 4. 转换至适配模型输入格式 最后一步就是把经过上述几个阶段加工后的干净整齐有序排列好的数值型数按照特定规则重新织成为符合所选用深度神经网络架构需求规格大小形状之类的张量形式喂给它吃下去消化吸收掉完成整个端到端全流程闭环运作模式构建工作啦!比如说对于二维平面切片来说一般会构建成批次数量×高度宽度通道数这样的四维TensorFlow/Keras标准样式供卷积层读取运算使用哦~ ```python import numpy as np from sklearn.decomposition import PCA def preprocess_radiomics_features(features): """ Preprocess radiomics features using PCA. Args: features (numpy.ndarray): Original feature matrix with shape (n_samples, n_features). Returns: reduced_features (numpy.ndarray): Reduced dimensionality feature matrix after applying PCA. """ pca = PCA(n_components=0.95) # Retain 95% variance reduced_features = pca.fit_transform(features) return reduced_features ```
评论 21
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值