生存分析回归模型的构建与可视化
生存分析是一种统计方法,用于研究时间至特定事件(如死亡、疾病复发)之间的关系。在生存分析中,我们常使用Cox比例风险模型来估计事件风险与预测因子之间的关联。而R语言提供了丰富的工具包来进行生存分析,并结合forestmodel包可以可视化生存回归模型对应的森林图。
首先,我们需要加载所需的R包,其中包括survival和forestmodel。
# 加载所需包
library(survival)
library(forestmodel)
接下来,我们准备一个示例数据集进行分析。这里以常用的lung数据集为例,该数据集包含了肺癌患者的生存时间及其他相关变量。
# 加载示例数据集
data(lung)
现在,我们使用Cox比例风险模型构建生存回归模型,使用coxph()函数进行拟合。假设我们关注的是性别和年龄对生存时间的影响。
# 构建生存回归模型
model <- coxph(Surv(time, status) ~ sex + age, data = lung)
完成模型的构建后,我们可以使用forest_model()函数来可视化模型对应的森林图。这个函数会绘制每个预测因子的估计效应及其置信区间。
# 可视化生存回归模型的森林图
forest_model(model)
以上代码将生成一个包含性别和年龄对生存时间影响的森林图。森林图可以清晰地显示每个预测因子的效应大小和相关统计指标
本文介绍了如何利用R语言的survival和forestmodel包进行生存分析,特别是通过Cox比例风险模型来研究事件(如死亡)与预测因子的关系。文章以肺癌患者数据集为例,展示构建模型并使用forest_model函数生成森林图的过程,以理解性别和年龄对生存时间的影响。此外,还提到了模型摘要和实际应用中的注意事项。
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