poj2778 DNA Sequence(AC自动机+矩阵快速幂)

poj 2778 DNA Sequence(AC自动机+矩阵快速幂) 题目链接:poj 2778 DNA Sequence 题目大意:给定一些含有疾病的DNA序列,现在给定DNA长度,问有多少种不同的DNA序列是健康的。 解题思路:对DNA片段建立AC自动机,因为最多10个串,每个串最长为10,所以最多可能有100个节点,在长度为n时 以每个节点终止的健康字符串个数形成一个状态集,通过AC自动机形成的边可以推导出n+1的状态集,走到单词节点是 阅读详情

题目

给你一个m,一个n,

m个要被禁止的模式串,

问长度恰为n的串里,

不包含任意一个模式串的方案数是多少

方案数模10W

思路来源

https://blog.youkuaiyun.com/morgan_xww/article/details/7834801(思路,强烈推荐,博主好文)

https://blog.youkuaiyun.com/u013446688/article/details/47378255(代码)

题解

把AC自动机上的每个节点的编号看作是一个状态,

是一种独一无二的状态,而状态i->状态j转移,

即取决于中间的边A,T,C,G,

这样边合法当且仅当两个节点合法

①一个模式串的尾一定不合法,

那么fail是一个模式串的尾的地方也不合法

比如ACGT,CG,第二个CG在G处不合法,则第一个G也不合法

②每个字符都可以像A,T,C,G转移

而可能在自动机里A无法向A转移,因为A的后继A不存在,

这时我们就把该节点的后继,赋值为该节点fail的后继即可,

由于最坏情况也不过是该节点的fail==root,

从而在不添加新节点的情况下把后继赋成自己,

不会造成死循环,所以是可行的

③如果ac自动机里最后cnt个节点,那矩阵M的规模是cnt*cnt的

矩阵M[i][j]记录的是长度为1的串中状态i->状态j有M[i][j]种转移方案(注意状态是点,两个点夹一条边)

其n次幂即为长度为n的串的方案数,矩阵快速幂一波即可

心得

本来矩阵快速幂写了个递归的,结果爆栈了返回RE,

还以为数组开小了,或是下标写错了

一题苟快2h才调出来,还是循环大法好啊

愿长记此题,不辱使命

代码

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<algorithm>
#include<map>
using namespace std;
typedef long long ll;
const int mod=100000;
struct node
{
  int fail,Next[4];    
  bool tag;
}trie[105];
char s[105];
int que[105];//建ac自动机的队列 
int root,tot;//根的编号 节点编号 
map<char,int>id;
ll m,n,ans;
struct Matrix
{
	ll a[110][110];
	int r;
	Matrix():r(105){
		memset(a,0,sizeof a);
	}
	Matrix(int n):r(n)//考虑0次的单位矩阵 
	{
		for(int i=0;i<n;++i)
		{
			for(int j=0;j<n;++j)
			{
				a[i][j]=0;
			}
		}
	}
	Matrix operator*(const Matrix &b)const
	{
		Matrix tmp(r);
		for(int i=0;i<r;++i)
		{
			for(int j=0;j<r;++j)
			{
				for(int k=0;k<r;++k)
				{
					tmp.a[i][j]+=(a[i][k]*b.a[k][j])%mod;
					if(tmp.a[i][j]>=mod)tmp.a[i][j]%=mod;
				}
			}
		}
		return tmp;
	}
}M;
Matrix modpow(Matrix x,ll n,ll mod)
{
	/*
	if(n==1)return x;
	Matrix p(x.r);
	p=modpow(x,n/2,mod);
	Matrix res(x.r);
	res=p*p;
	if(n&1)res=res*x;
	return res;*/
	Matrix p(x.r);
	for(int i=0;i<p.r;++i)p.a[i][i]=1;
	while(n)
	{
		if(n&1)p=p*x;
		x=x*x,n/=2;
	}
	return p;
}
void init1()
{
	id['A']=0,id['T']=1;
	id['C']=2,id['G']=3;
	trie[0].tag=0;//向虚节点转移 
}
void init2()
{
	memset(trie,0,sizeof trie);//只刷一个,之后插入的时候再刷 
	ans=tot=0;
	root=++tot;
}
void insert(int r,char *s)//(root,串),trie树插入 
{
   int len=strlen(s);
   for(int i=0;i<len;i++)
   {
      if(trie[r].Next[id[s[i]]]==0)
	  {
	   trie[r].Next[id[s[i]]]=++tot;
	   trie[trie[r].Next[id[s[i]]]].tag=0;
      }
      r=trie[r].Next[id[s[i]]];
   }     
   trie[r].tag=1;//是病毒的结尾 
   //if(trie[r].tag)printf("%d\n",r);
}
void build(int r)//建ac自动机 
{
  int head=0,tail=0;
  trie[r].fail=r;//root自己连自己 
  que[tail++]=r;
  while(head<tail)
  {
    r=que[head++];
    if(trie[trie[r].fail].tag)trie[r].tag=1;//后缀的最后一个字母是病毒 那么自己也是 importance1
    for(int i=0;i<4;i++)
    {
      int ch=trie[r].Next[i],failp;
      if(ch)
      {
        que[tail++]=ch;
        for(failp=trie[r].fail;failp!=root&&trie[failp].Next[i]==0;failp=trie[failp].fail);//向前回跳 
        if(trie[failp].Next[i]==0||trie[failp].Next[i]==ch)trie[ch].fail=failp;//接到根或者自己 
		else trie[ch].fail=trie[failp].Next[i];//可以后接 
      }
      else trie[r].Next[i]=trie[trie[r].fail].Next[i];//和fail续一个一模一样的后继 importance2
    }
  }     
}
/*
void debug()
{
	for(int i=0;i<M.r;++i)
    {
    	for(int j=0;j<M.c;++j)
    	printf("%lld ",M.a[i][j]);
    	puts("");
    }
}*/ 
void buildMatrix()
{
	 M=Matrix(tot);
	 for(int i=1;i<=tot;++i)
	 {
	   //if(trie[i].tag) printf("%d ",i);
	   for(int j=0;j<4;++j)
	   {
	  	 if(!trie[i].tag&&!trie[trie[i].Next[j]].tag)
	  	 M.a[i-1][max(trie[i].Next[j]-1,0)]++;
	   }  
	 } 
	 //debug();
}
int main()
{
	init1(); 
    while(~scanf("%d%d",&m,&n))
    {
    init2();   
    for(int i=0;i<m;i++)
    {
      scanf("%s",s);
      insert(root,s);
    }
    build(root);
    buildMatrix();
    M=modpow(M,n,mod);
    //debug();
    for(int i=0;i<tot;++i)
    {
    	ans+=M.a[0][i];
    	if(ans>=mod)ans%=mod;
    }
    printf("%lld\n",ans);
    }
    return 0;
}

 

DNA Sequence POJ - 2778(AC自动机+矩阵快速幂) It’s well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it’s very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For example, if a animal’s DNA sequence contains segment ATC then it may mean that the animal may have a genetic disease. 阅读详情

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