【业务介绍】非靶数据库包括5W+物质,检出高达1500种

非靶向代谢组学(Untargeted metabolomics)是一种分析生物样本中所有可检测代谢物的方法。其中LC-MS非靶向代谢组学是一种利用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)无偏向性地检测生物体内所有小分子代谢物的动态变化的技术。由于环境对生物体的影响会最终体现为代谢物的变化,因此LC-MS非靶向代谢组学在动物生长发育、疾病生物标志物(Biomarker)筛选、药物研发等领域的应用越来越广泛。

一、原理简介

LC-MS非靶向代谢组学采用高效液相色谱作为分离系统,以高分辨率质谱为检测系统,对样本中的代谢物进行分析检测。质谱检测主要是基于被测代谢物的质荷比(m/z)不同,选择数据依赖性扫描方式(DDA)对代谢物进行扫描,即对选定范围内质荷比的母离子进行全扫描,获得一级谱图,然后从全扫描质谱中选择的多个母离子进行二级扫描,获得二级谱图。最后使用一级谱图和二级谱图与数据库匹配进行代谢物的鉴定和定量分析。该技术具有样品前处理简单、检测范围广、分离能力强等优点,是代谢组学研究中常用的分析手段。

图1 数据依赖性扫描方式原理图(Jian et al., 2020)。

二、数据库介绍

LC-MS非靶向代谢组学的数据库是结合Metlin、mzCloud、HMDB、GNPS、MassBank、LipidBlas、Lipidmaps公共库及标准品而建立,其中数据库包括50000+种物质,标准品有4000+物质。数据库的物质类型包括脂质、氨基酸、固醇、碳水化合物、有机酸、类花生酸、胆汁酸、核苷酸、辅酶、维生素、短肽、生物碱、苯环型化合物、杂环化合物、醇类、胺类、酮类、醛类、酯类、酚类等50000+种代谢物。

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表1 LC-MS非靶向代谢组学数据库(部分展示)。

、不同物种组织物质检出:1000~1500+种

我司对兔子的各种组织及血清,人血清、尿液,小鼠血清、肝脏,大鼠血浆样本进行LC-MS非靶向代谢组学检测,发现发现不同物种组织检出代谢物的数量在1000~1500+种之间。注意样本代谢物的检出情况与样本的处理、组织类型等相关,因此下面数据仅供参考。

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图2 不同物种组织代谢物的检出情况。

、技术路线

LC-MS非靶代谢组学的技术路线包括实验检测和数据分析两大部分,其中实验部分包括样本收集、代谢物提取、代谢物检测,数据分析包括原始数据的处理、数据质控、数据评估、统计分析。统计分析通过单变量统计分析和多变量统计分析方法,筛选出组间差异的代谢物,然后对其代谢通路进行分析。

代谢组技术路线.jpg

图3 LC-MS非靶向代谢组学检测技术路线图。

五、我司优势

1、数据库大:包括Metlin、mzCloud、GNPS、MassBank、HMDB、LipidBlas、Lipidmaps 7大数据库5W+个物质;

2、物质检出数多:项目可检出1000-1500+种代谢物;

3、分析全面:包括PCA、OPLS-DA、聚类热图、雷达图、VIP值图、火山图、KEGG分析等26项分析内容。

4、分辨率高:基于Orbitrap Exploris 120高分辨质谱仪,可从复杂样品的基质干扰中解析更多的目标离子。

、样品要求

 七、实验周期及交付结果

1、实验周期:20个工作日。

2、交付标准:QC样品TIC重叠谱图好,QC样本CV值小于0.3的物质占比高于70%。

3、交付结果包括:完整的结题报告(包括实验方法、代谢物定性定量结果、生物信息学分析结果)和实验原始数据(raw文件)。

参考文献

Jian G, Tao H.Comparison of Full-Scan, Data-Dependent, and Data-Independent Acquisition Modes in Liquid Chromatography–Mass Spectrometry Based Untargeted Metabolomics[J]. Analytical Chemistry, 2020, 92(12) : 8072-8080.

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