Seurat版本到底如何通用(记录疑问(未解决

背景:

按老师们的教程安装了V4&V5版本的Seurat:

https://mdnice.com/writing/f5c343b0df0342abae5383e2541cf4f8

简单可行的SeruatV4和v5共存的安装方案_下载seurat 4版本-优快云博客

正使用V4版本的Seurat。

1. 关于DoubletFinder::ParamSweep_v3

https://blog.youkuaiyun.com/Valentine_faye/article/details/136453188

Error in paramSweep_v3(scRNA_r, PCs = 1:30, sct = FALSE) : could not find function "paramSweep_v3" · Issue #184 · chris-mcginnis-ucsf/DoubletFinder · GitHub

>>未解决V4版本SeuratObject和DoubletFinder不通用问题:最新版DoubletFinder适配V5版本SeuratObject(DoubletFinder::ParamSweep),旧版本DoubletFinder(DoubletFinder::ParamSweep_v3)无法成功安装并调用该函数。

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