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原创 png:unable to open connection to X11 display
报错表明 R 无法启动 PNG 设备,通常是因为缺少 X11 显示服务器或者 R 没有访问权限。与 “服务器未开启图形界面” 矛盾,所以PNG只能寄了。R 语言画图排雷 1。
2024-07-30 09:54:46
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原创 Rocky 9 安装 pysam 极简版
使用的Anaconda,本来想就着原来的环境,结果GG了。一键安装: pip install pysam。事情如果如此简单也就不用写这个博客了。mamba的安装在我另一篇。
2024-06-20 09:05:37
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原创 kraken2 最新版安装,极简模式
不晓得是不是我设置了清华源,导致conda 或者mamba都无法安装当前的最新版2.1.3,只能通过github的“install_kraken2.sh”安装。
2024-05-07 23:56:07
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原创 Centos 系列 安装ArchR
2.2 基本按照Github的流程安装,Seurat需要自己安装,具体步骤在我的另一篇。理想是丰满的,现实很骨感。2.1 解决依赖问题。
2024-04-30 14:37:39
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原创 加载infercnv报错“../JAGS/modules-4/basemod.so”
2,调用conda 环境报错,显然是路径问题,通过GPT、谷歌查找,使用下面两条命令,一、 Plantform。系统:Rocky 9。二、Schedule。
2024-04-08 08:54:38
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原创 Seurat 降级:从V5降级到V4
Seurat更新增加了一些功能,由于前期都是V4的结果,当使用过程中,容易报错,于是想降级。方法一:降级软件版本,参考。方法二:格式转化,参考。
2024-03-15 11:01:58
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原创 Rocky 9 安装 scCustomize
安装R包的核心思想就是,先install.packages("scCustomize"),如果失败则去。其实这个包有时候就可以这样按,只是需要安装几个依赖。
2024-03-06 13:53:12
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原创 内存条无法识别 No Module Installed
通过插拔 和 dmidecode 命令 确认异常在几号槽,使用 htop free 等命令确认内存条识别异常,系统环境 : Rocky linux 9。重新插拔内存条,并使用橡皮擦拭内存条的。方法虽土,但是有效。
2024-03-03 10:38:37
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原创 Linux 安装pip和换源
用户级配置:~/.pip/pip.conf 或 ~/.config/pip/pip.conf。全局配置:/etc/pip.conf。
2024-03-03 10:26:45
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原创 Rocky 9 安装 R-CytoTRACE
给出的详细指南,只是可能大家打不开或者懒得去看E文。第二步,打开R或者Rstudio-server。第一步,下载CytoTRACE安装包。第三步,安装python相关的包。第四步,设置Python路径。
2024-03-03 00:26:18
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原创 Anaconda安装与初始化
安装很简单,accpet--安装路径(默认在~/anaconda3)--yes。Step 1: anaconda 配置环境变量。Step 2: anaconda 换源。Step 3: 清理已有缓存和索引。Step 4: 升级conda。Step 5: 备份与还原。
2024-02-09 23:10:34
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原创 Rocky 9 安装 Rstudio Server
用“RStudio Server”, 谷歌秒出官网,度娘一堆广告。# 吐槽一下度娘,真心拉胯。
2024-02-08 22:35:06
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原创 Rstudio-Server调用conda环境包GLIB版本异常
方法二:使用默认R自动library,然后在Rstudio-Server导入libPaths。再将/home/Your_name/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.3切换为默认路径,这样安装的库就在自己的家目录下,不影响其他人的使用。其中/data/anaconda3/envs/public/lib中安装了 R4.3.2,并预装了许多需要使用的库。实验环境:Rocky linux 9.2。方法一:修改R,添加conda环境路径。
2024-02-07 23:59:20
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原创 KVM迁移
virsh start win2008_svn_server 启动win2008_svn_server。virsh shutdown win2008_svn_server 关闭win2008_svn_server。scp传输数据盘文件,因为数据文件备份在ubuntu上所以需要-o。在源服务器用dumpxml复制配置文件。首选将所需文件拷贝到新服务器。1、拷贝备份到新服务器目录。2 在新服务器上安装kvm。系统是centos6.5。
2023-12-16 10:51:17
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原创 安装spams
小结:未完待续,建议装python3.8, 之后的版本经常找不到已编译的binary包,或者各种工具之间的兼容性问题。上面这个网站有时候会打不开,可以去Github,一般99%都OK了。或者指定从PyPI安装。然后规则之外总有例外。
2023-11-20 08:34:44
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原创 如何将pytorch-lightning训练的结果ckpt转为pytorch的pt?
net.”是由于我定义pl模型的时候弄的,改模型太累,改字典很轻松。注:苦寻无果后,自己倒腾出来的。一 简单展示一下我是怎么保存lightning。# 寒冬已至,昼短苦夜长。我是怎么在绝望中前行的。
2023-11-09 00:27:36
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原创 我在Rocky Linux 9 安装pyvips
它支持多种图像格式,包括JPEG、PNG、TIFF等,以及特定于libvips的高效图像格式。libvips还提供了各种图像处理功能,如调整大小、剪裁、旋转、缩放、色彩转换等,以及更高级的功能,如图像锐化、合并、拼接和特效处理。pyvips是一个Python绑定,用于访问libvips库,它是一个用于处理大型图像的快速和低内存库。pyvips主要用于执行高效的图像处理操作,尤其是对大型图像或需要大规模批量处理的图像。1)pyvips 是调用的libvips,先使用命令验证是否安装了。等有时间再来填bug。
2023-11-06 08:13:35
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原创 pyvips安装
而只要你使用过 md,那你一定听说或使用过 typora,它之所以备受推崇,是因为它推出了一项非常重要的功能:「实时预览(Live preview)」,实现了所见即所得,使用体验大幅提升。在网上兜兜转转,发现一款 md 笔记软件,这款软件就叫 Obsidian(简称 Ob),这款软件个人使用是免费的,商用才要收费,同时支持众多插件。GitHub的仓库:https://github.com/obsidianmd/obsidian-releases。当然了,只要你不升级继续使用旧版,typora 还是免费的;
2023-10-14 17:00:19
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原创 ubuntu 20配置Nvidia显卡为最高性能
若输入 sudo systemctl start display-manager, 则 电源模式又会变成P8。重启NVIDIA X Server 不影响电源策略:sudo service lightdm start。弹出的图形界面设置成功,但本人测试该方法已失效。注,本人的超龙RTX3070已魔改为16G显存。需要先使用命令停止显示服务器。
2023-07-18 15:34:25
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翻译 Neural Network Encapsulation (ECCV2018)
在本文中,我们提出了一种新的神经网络结构——神经网络封装(Neural Network Encapsulation,简称NNE)。NNE是一种可以将多个神经网络结构组合成一个整体的方法,可以有效地提高神经网络的表现和泛化能力。我们还提出了一种基于NNE的新型正则化方法,称为封装正则化(Encapsulation Regularization),可以在训练过程中有效地控制模型的复杂度和泛化误差。通过实验,我们证明了NNE和封装正则化的有效性和优越性,并且展示了在多个数据集和任务上的应用。
2023-04-18 17:50:26
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原创 论文中稿 IEEE ACCESS 期刊
FixCaps: An Improved Capsules Network for Diagnosis of Skin Cancer,DOI: 10.1109/ACCESS.2022.3181225
2022-10-04 12:06:07
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原创 那些年我踩过的坑--计算FLOPs
一 Pytorchpytorch有很多种包,有特殊需求的可以去GitHub上再找找。(天也不 早了,我就简单掰扯几句)1 安装#conda 的某个环境下安装pip install --upgrade git+https://github.com/Lyken17/pytorch-OpCounter.gitpip install onnx2 导入模块#此处省略了模块的导入,网上教程很多,不多做赘述。from thop.profile import profilenetwork
2022-05-25 00:55:44
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原创 U20.4 升级 pytorch 1.11
一 系统环境1,系统已安装 pytorch 1.7 , 1.8a)pip install torch==1.8.2+cu111 torchvision==0.9.2+cu111 torchaudio===0.8.2 -f https://download.pytorch.org/whl/lts/1.8/torch_lts.html或者https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.htmlcu111/torch-1.8.1%2Bcu111-cp
2022-05-17 10:41:19
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原创 自己搭建个两层神经网络来跑跑“Hello World”--MNIST
import numpy as npimport pandas as pdimport matplotlib.pylab as pltimport pickleimport sys, ossys.path.append(os.pardir)In [3]def cross_entropy_error(y, t): if y.ndim == 1: t = t.reshape(1, t.size) y = y.reshape(1, y.size) .
2021-05-11 15:22:59
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原创 在MNIST上用Pytorch跑跑GPU
目录前言一、Pytorch的入门二、使用步骤1.引入库2.读入数据3.定义卷积神经网络4.Training5.在测试集上测试模型总结前言深度学习中有很多入门数据,MNIST被称为机器学习的“Hello World”,一个人能否入门深度学习往往就是以能否玩转MNIST数据来判断的。PyTorch有一个很好的模块nn,它提供了一种有效构建大型神经网络的好方法。我们将按顺序执行以下步骤:使用torchvision加载并标准化 MNIST 训练和测试数据集
2021-05-03 00:33:21
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原创 新人在阅读深度学习论文时,常常会遇到的几个困惑。
深度学习是时下AI领域的研究热点,但是很多大佬的“简单”、“显然”等,对新人而言可能需要花几天几夜时间查找资料才能理解。正是出于这样的考量,本文以BBN的阅读为例,列举了几个“简单”的常识。BBN: Bilateral-Branch Network with Cumulative Learning for Long-Tailed Visual RecognitionAuthors:Boyan Zhou, Quan Cui, Xiu-Shen Wei, Zhao-Min Chen【概述】数据分
2021-04-25 11:52:54
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原创 centos 6 换源
#主要是为了提高安装速度以及epel中自带源众多木有的软件。 #Author wood_man 1. 测试环境VMware 10.0 CentOS release 6.6 (Final) i386 kernel 2.6.32-504.el6.i686 2.准备工作(1) 删除yum源#rm -f /etc/yum.repo.d/*
2016-02-29 14:51:08
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原创 Red Hat 6 换源
#由于redhat的yum在线更新要收费,即没有注册的无法使用;#将redhat的yum卸载、重装第三方源。 #第三方源包括:网易,重庆大学,epel 等#RHEL6.5_x86_64#Author wood_man.#测试环境#VMware 10.0#RHEL6.5_x86_64#Start 1 删除原因的yum rpm -aq|grep
2016-02-29 14:49:30
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原创 如何删除VLAN
虽然不同品牌的交换机的命令有所差别,但许多命令都是可以通用的。话回正题 如果是删除二层交换机的VLAN直接用 SWITCH (CONF)# NO VLAN ID如果是删除三层交换机的VLAN就稍微复杂些 1 :只是划分了VLAN而没有其他操作,那么删除方法同上; 2 :划分了VLAN 并且加了interf
2010-04-05 09:48:00
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1
linux系统管理手册第二版3(part7-8)
2014-07-11
linux系统管理手册第二版2(part4-6)
2014-07-11
思科设备网络实验手册.doc
2012-03-25
锐捷交换机的配置集.doc
2012-03-25
dlink三成交换机入门配置说明
2012-03-18
USG2200.TXT
2012-03-18
ASA5520 HA配置.txt
2011-09-27
实验记录.rar
2011-09-27
cisco-asa-5505基本配置.text
2011-09-27
h3c配置命令.txt
2011-06-02
限制QQ登陆.txt
2011-06-01
限制对迅雷等P2P软件软件的ACL
2011-06-01
stp协议常用命令.txt
2011-03-29
配置保护端口.txt
2010-05-30
端口流量控制.txt
2010-05-30
基于端口的传输控制.txt
2010-05-30
服务配置(DHCP 服务配置,交换机dot1x 认证配置).txt
2010-05-30
电脑故障维修判断指导大全chm
2010-03-11
计算机等级考试三级网络技术
2010-03-11
WinRAR帮助文档 chm
2010-03-03
Yann LeCun (paper_set)
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编译安装zabbix-2.4.7
2016-02-29
apache 虚拟主机
2016-01-09
Linux 常用命令整理
2016-01-09
Linux系统管理技术手册(第二版)高清版part5(最后一个)
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Linux系统管理技术手册(第二版).高清版.part4
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Linux系统管理技术手册(第二版).高清版.part3
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Linux系统管理技术手册(第二版).高清版.part2
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Linux系统管理技术手册(第二版).高清版.part1
2014-07-17
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