代谢组学数据分析及网络药理学研究技术与实践

最新推荐文章于 2025-09-23 15:46:23 发布
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本文探讨了代谢组学的数据分析方法及其在网络药理学中的应用，详细介绍了相关研究技术和实际操作步骤。

一、代谢组学研究技术与实践

 

1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨

1.1 代谢组学概述

1.2 代谢组学操作流程

1.3 样本的采集、储存与制备关键问题

2、代谢组学数据采集与预处理，决定数据统计结果的准确性

2.1 常用技术平台介绍（NMR和LC-MS）

2.2 常用软件和数据库介绍（代谢物鉴定、数据预处理与分析）

2.3 数据预处理，包括数据归一化、标准化和数据转化以及缺失值评估等
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TCMNP包教程：这个R包够猛！除了药物+疾病+靶点+转录因子数据库，还能做网络药理学全流程可视化分析？！
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2024-中药网络药理学-教程(全网最牛逼)
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2021网络药理学研究的免费数据库、在线平台与软件工具汇总整理介绍
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然后我们依次将前面步骤得到的中药活性成分都重复如上步骤，得到各个成分的潜在靶点，汇总并去重，范围一般是几十到几百个。列代表着作用在该靶点上的可能性，我们一般根据这个由大到小排列，然后选取结果集的前5/10/15/20个。是靶点的通用名，也就是常用的基因名，一般我们只要这一列（有时候前三列都有点作用）。结构渲染出来，确认下是否是我们想要的活性成分的结构。，即任务ID，我们需要保存好它，然后去到。要注意的是，如果我们的论文里面使用了。是人类种的意思，一般不需要更改。网站首页如下，我们主要关注的是。
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中药网络药理学要解决的一个核心问题是，如何在疾病相关网络的背景下，评价中药的多成分、多靶点的协同作用。根据中药方剂成分复杂、靶点不清、以全面调节的方式干预复杂疾病的特点，研究者们提出了一些中药网络药理学的研究路线，如图1就是一个典型的中药复方研究的网络药理学路线图。这个路线图包括数据获取和网络分析两大部分。需要获取的数据包括中药方剂的有效活性成分、活性化合物的靶点和疾病相关基因等。基于这些数据，构建和分析疾病相关网络、药物影响网络，识别疾病和药物影响的信号通路和生物学过程，能帮助我们阐明中药方剂的作用机制。
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当药物进入生物体时，往往存在着一个瀑布效应。举例：1级是药物成分，2级是成分作用的靶点（在这靶点不再是网药中的狭隘的定义，而是广义的定义），3级是靶点调控的分子。更具体点来说，以槲皮素为例，1级是槲皮素这个成分，2级是Nrf2 信号通路（槲皮素常作用的位置），3级是超氧化物歧化酶（又称SOD，是通路中槲皮素具体作用的受体蛋白，或者说分子）。一个药物之所以能治病，就是因为在人体内有着如上的1级、2级、3级这样层层传递的瀑布效应，最终具体落到的是分子层面或者说蛋白层面。
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基博的博客
11-07 5608
嗯，学习网络药理学，记录怎么画成分靶点网络，很多理论还没掌握，都是看着视频和文献照虎画猫（笑）
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