【AI4S】Motif-Driven Contrastive Learning of Graph Representations

一种用于图表征的"MOTIF"驱动的自监督学习框架


本文介绍一篇名为"MOTIF-Driven Contrastive Learning of Graph Representations"的论文,该论文提出了一种新的图学习框架MOTIF,可以同时训练图神经网络(GNN)来学习子图表示,并基于它们的语义将这些表示聚类成模式(motif)。作者通过在分子属性预测数据集上进行实验验证了MOTIF的有效性,并且与现有的自监督方法进行了比较。MOTIF还可以增强药物发现和量子化学中的分子属性预测能力,并且更加可解释。未来,作者计划引入采样损失项和端到端池化来进行子图表示的学习。

引言

图表示学习助力了众多应用,例如预测分子的性质。然而,这些应用通常资源匮乏,因为获取标签的成本高昂,这使得它们非常适合采用自监督学习方法。目前,已有一些针对图级别表示学习的自监督方法,包括InfoGraph(Sun等,2019)、GPT-GNN(Hu等,2020)以及Context Prediction(Hu等,2020)。

MOTIF

之前的方法未能充分利用数据集中各图之间显著子图的共性,这些共性被称为“基序”,往往反映了图级别的语义特性。为此,我们提出了一种名为MOTIF的自监督框架,该框架可同时训练图神经网络(GNN)以学习子图表示,并根据其语义特征对这些表示进行聚类,从而挖掘出基序(参见图1)。通过这种方式,我们能够为多种图级别的下游任务(如分子性质预测)预先训练GNN。在MOTIF的每一轮迭代中,我们首先通过采样子图并将这些子图输入GNN,获得相应的子图表示

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