【PaperReading】Computational network biology: Data, models, and applications

本文综述了计算网络生物学在生物网络结构分析、关键生物分子识别、网络疾病研究及药物研发中的应用。研究显示生物网络的结构与生物功能密切相关,通过网络分析能识别关键生物分子,理解疾病的发生机制,并指导药物研发。计算方法如网络传播和网络控制性分析在识别疾病基因和药物靶点中起到关键作用。网络疾病和药物-基因-疾病网络的分析为药物研发提供了新思路,如旧药新用和药物组合疗法。未来挑战包括生物网络数据的质量与完整性、多层次网络分析和多学科交叉验证。

计算网络生物学长文综述:数据、模型和应用

计算网络生物学综述
论文地址:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0370157319304041


生物网络是网络科学研究的重要方向,其相关研究伴随着网络科学的发展和生物数据技术的进步,在近年来取得了突飞猛进的进展。生物网络是以生物分子作为节点,分子之间的相互关联为连边构成的系统(如图1所示)。生物网络种类繁多,比较常见的主要有蛋白-蛋白互作网络基因调控网络基因关联网络代谢网络脑网络等等。本文将以疾病相关的生物网络计算研究为主要对象,从下述几个方面进行介绍。

生物网络类型

1.网络结构与生物功能

生物网络

《计算流体力学:原理与应用(第二版)》是Blazek J.(作者)编写的一本关于计算流体力学的书籍。它是该领域中一本权威的教材,被广泛用于工程、物理学和气象学等领域的教学和研究。 这本书详细介绍了计算流体力学的基本原理和方法。计算流体力学是一种利用数值方法来模拟流体流动的科学与工程领域。它结合了流体力学的基本方程和计算机算法,可以用来解决各种流体流动问题,如水力学、空气动力学、热传导等。 该书的第二版相对于第一版进行了更新和扩充。它涵盖了更多的应用案例和实例,以及最新的计算流体力学发展和技术。除了介绍基本的数值方法和离散化技术,书中还详细讨论了网格生成、边界条件、初始条件等问题。 此外,书中还介绍了计算流体力学在不同领域的具体应用。它涵盖了航空航天、汽车工程、能源系统、气象学、生物医学等多个领域的应用案例。通过这些案例,读者可以更好地理解和应用计算流体力学在不同实际问题中的作用和意义。 总的来说,Blazek J.的《计算流体力学:原理与应用(第二版)》是一本对计算流体力学进行全面而深入介绍的教材。它不仅适用于从事相关研究和工作的科学家和工程师,也适合作为大学本科和研究生水平的课程教材。通过学习这本书,读者能够掌握计算流体力学的基本理论和方法,并能够应用到实际问题中。
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