Computational network biology: Data, models, and applications
计算网络生物学长文综述:数据、模型和应用

论文地址:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0370157319304041
生物网络是网络科学研究的重要方向,其相关研究伴随着网络科学的发展和生物数据技术的进步,在近年来取得了突飞猛进的进展。生物网络是以生物分子作为节点,分子之间的相互关联为连边构成的系统(如图1所示)。生物网络种类繁多,比较常见的主要有蛋白-蛋白互作网络、基因调控网络、基因关联网络、代谢网络、脑网络等等。本文将以疾病相关的生物网络计算研究为主要对象,从下述几个方面进行介绍。

1.网络结构与生物功能
生物网络
本文综述了计算网络生物学在生物网络结构分析、关键生物分子识别、网络疾病研究及药物研发中的应用。研究显示生物网络的结构与生物功能密切相关,通过网络分析能识别关键生物分子,理解疾病的发生机制,并指导药物研发。计算方法如网络传播和网络控制性分析在识别疾病基因和药物靶点中起到关键作用。网络疾病和药物-基因-疾病网络的分析为药物研发提供了新思路,如旧药新用和药物组合疗法。未来挑战包括生物网络数据的质量与完整性、多层次网络分析和多学科交叉验证。
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