【转录调控网络】典型的基因转录调控网络推导方法——微分方程方法

本文介绍了利用微分方程方法推导基因转录调控网络,采用反曲函数和非线性Michaelis-Menten函数来描述转录因子的调控特性。Chen的方法中,转录率由反曲函数的线性组合表示,而Nachman则使用动态贝叶斯网络,允许网络结构学习和定量参数识别。这种方法能定量计算转录子对靶基因的调控能力。

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典型的基因转录调控网络推导方法——微分方程方法


微分方程模型广泛应用于自然科学的各个领域,目前已应用于 基因调控网络转录调控网络推导中,并取得了较好的效果。

在建立微分方程时,考虑到反曲函数具有更能代表真是系统、控制基因表达和处理饱和与降解的分子开关的特征,一般选择反曲函数作为转录因子的调控函数。即:
f[a(t):α,β]=11+exp{ −αa(t)+β}(1)f[a(t):\alpha ,\beta ]=\frac{1}{1+exp\{-\alpha a(t)+\beta \}} (1)f[a(t):

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