56、并行计算中的文件操作与开发工具

并行计算中的文件操作与开发工具

1. 并行文件操作概述

在并行应用中，处理标准文件操作有其特定的方法。对于适度的并行应用，让所有 IO 操作都由第一个处理器执行的简单技术就足够了。而 MPI - IO 是并行文件操作的重要组成部分，它能显著加快文件的读写速度。使用自描述的并行 HDF5 软件也有诸多优势，HDF5 格式能在实现快速文件操作的同时，改善应用程序的数据管理方式。此外，查询和设置并行文件软件及文件系统的提示信息，有助于提升特定系统上的文件读写性能。

1.1 通用文件系统提示

有时，为应用程序中的文件操作类型提供一些提示是很有用的。可以通过环境变量、提示文件或在运行时使用 MPI_Info_set 来修改并行文件设置。以下是不同库的设置命令：
- Cray MPICH ：

MPICH_MPIIO_HINTS=”*:<key>=<value>:<key>=<value>
# 示例
export MPICH_MPIIO_HINTS=\
   ”*:striping_factor=8:striping_unit=4194304”

• ROMIO ：

ROMIO_HINTS=<filename> 
# 示例
ROMIO_HINTS=romio - hints