项目实战:医疗流式细胞术数据文件

本文介绍如何将医疗流式细胞术的FCS数据文件解析成元数据和数据,并导出为Excel表格。FCS标准历经多次修订,最新版本FCS3.2满足了新的需求。文章提供了原始文件、解析后的元数据和数据示例,以及最终的Excel导出结果。

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需求

   解析医疗实验室数据文件*.fcs。

Demo导出数据

在这里插入图片描述

医疗流式细胞术数据文件标准(.fcs)

  流式细胞术数据文件标准于1984年发布,以促进流式细胞术数据分析软件与在不同类型的流式细胞术仪器上获取的数据的互操作性。
  该标准在1990年修订为FCS 2.0,在1997年修订为FCS 3.0,在2010年修订为FCS 3.1。2020年9月3日Spidlen J等人在Cytometry A杂志上提出了FCS 3.2,该修订版满足了一些新需求和建议,并结合了十年来整个细胞仪领域的进步。
  FCS 3.2规范完整版可以下载(全英文):http://flowcyt.sf.net/fcs/fcs32.pdf
在这里插入图片描述

  原始输入文件如下:
  在这里插入图片描述
  解析出来meta元数据如下:
  在这里插入图片描述
  解析出来data数据如下:
  在这里插入图片描述
 导出excel表如下:
  在这里插入图片描述

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