【单细胞】Scanpy进行数据归一化

最新推荐文章于 2025-05-27 20:12:36 发布
最新推荐文章于 2025-05-27 20:12:36 发布
阅读量549 收藏 1
点赞数
分类专栏： 生物信息 文章标签： 单细胞
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/zfhsfdhdfajhsr/article/details/128869627
版权
Scanpy的pp.scale函数用于将单细胞数据归一化，确保mean等于0且variance等于1。即使某些基因没有方差，该函数也会保留它们，如果启用zero_center选项，零值会被设为0，否则无方差的基因将被移除。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

1 功能

scanpy.pp.scale

将数据归一化到mean=0，var=1。
如果某个基因没有任何方差，也会被保留，如果设置了zero_center=True，那么会设置为0 ，未来会设置为NaN。否则会丢掉这个基因。

2 参考文献

[1]利用scanpy进行数据归一化

Android图像处理值Region
gu_solo的博客
03-23 1037
Region.op：当两个区域重合时该如何处理，有6个取值： DIFFERENCE:：从region1中减去region2 INTERSECT：区region1和region3部分 REPLACE：用region2替换region1 REVERCE_DIFFERENCE：从region2中减去region1 UNION：合并region1和region2 XOR：取region1和re
opengl api
gangyanliang的专栏
08-22 1200
OpenGL库函数列表 OpenGl核心函数库   glAccum 操作累加缓冲区 glAddSwapHintRectWIN 定义一组被SwapBuffers拷贝的三角形 glAlphaFunc允许设置alpha检测功能 glAreTexturesResident 决定特定的纹理对象是否常驻在纹理内存中 glArrayElement 定义一个被用于顶点渲染的数组成分 glBegin
OPENGL中的帧缓存区概述
weixin_30732825的博客
02-19 360
（1）帧缓存介绍 OPENGL系统的帧缓冲区是由所有存储着像素信息的缓冲区组成的，包括：颜色缓冲区、深度缓冲区、模板缓冲区、累积缓冲区。可以使用glGetIntegerv()查询特定画面可用的缓冲区的存储信息。 颜色缓冲区是用于绘图的缓冲区，它包含了颜色索引或者RGB颜色数据，还可能有alpha数据。若OPENGL支持立...
OpenGL库函数列表
水云间
06-30 1221
<br />OpenGl核心函数库 glAccum 操作累加缓冲区<br />glAddSwapHintRectWIN 定义一组被SwapBuffers拷贝的三角形<br />glAlphaFunc允许设置alpha检测功能<br />glAreTexturesResident 决定特定的纹理对象是否常驻在纹理内存中<br />glArrayElement 定义一个被用于顶点渲染的数组成分<br />glBegin,glEnd 定义一个或一组原始的顶点<br />glBindTexture 允许建立一个绑定
OpenGL帧缓冲区
weixin_34232744的博客
11-19 389
在OpenGL窗口中, 左下角的像素为(0, 0). 一般而言, 像素(x, y)占据的矩形区域左下角为(x, y), 右上角为(x+1, y+1). 10.1 缓存及其用途 1) 颜色缓存, 左前,右前,左后,右后和任意数量的辅助颜色缓存;2) 深度缓存3) 模板缓存4) 累积缓存 注意:X窗口系统,RGBA模式至少保证1个颜色缓冲区,模板缓冲区,深度缓冲区,累计缓冲区颜色索引模式至...
WARNING: The scripts pip, pip3 and pip3.9 are installed in '/home/lgc/.local/bin' which is not on PATH. Consider adding this directory to PATH or, if you prefer to suppress this warning, use --no-warn-script-location.
07-07
关于您的问题，您可以通过将'/home/lgc/.local/bin'目录添加到您的PATH环境变量中来解决此警告。这样做的方法会因操作系统而有所不同，下面是一些常见操作系统的解决方法： 对于Linux和macOS用户： 1. 打开终端。 2...
Inconsolata-LGC：Inconsolata LGC扩展
02-05
Inconsolata-LGC：Inconsolata LGC扩展
Opengl LGC_Lsys.rar
02-27
一个用opengl编写的植物根生长系统。
LGC算法-SCI经典
09-16
LGC算法，全称为Learning with Local and Global Consistency，是一种图学习算法，主要用于图上的半监督学习。该算法利用图的结构特征来传播标签信息，使具有相似结构的节点标签趋于一致。LGC算法的提出，是为了更好...
OpenGL实现的植物根系生长模拟系统
标题中的“Opengl LGC_Lsys.rar”指的是一个利用OpenGL图形库编写的程序文件包。OpenGL（Open Graphics Library）是一个跨语言、跨平台的应用程序编程接口（API），用于渲染2D和3D矢量图形。该库广泛应用于计算机...
Opengl纹理映射
wymhhgg99的专栏
01-11 1413
9.4 纹理对象 使用纹理对象来存储纹理数据的步骤: 1) 生成纹理对象名称 2) 将纹理对象绑定到纹理数据(包括图像数据数组和纹理属性), 即创建纹理对象. 3) 如果OpenGL实现高性能纹理工作集, 应检查是否有足够的空间来存储所有的纹理对象. 如没有足够空间, 应设置每个纹理对象的优先级, 以确保最常用的纹理留在工作集中 4) 绑定和重新绑定纹理对象, 以便可以将其中的纹理
opengl函数
鶸者为何战斗
06-03 741
1.glAccum--操作在多重缓冲区中进行; 2.glAlphaFunc--指定Alpha测试函数; 3.glBegin--开始操纵一组点进行画图; 4.glBitmap--再设备上画一指定属性的位图文件; 5.glBlendFunc--指定象素的算法; 6.glCallList-- 执行一个显示列表; 7.glCallLists-- 执行一组显示列表; 8.glClear--在视
帧缓冲区
依文依叶
07-04 3507
1.帧缓存包括颜色、scissor、alpha、stencil、depth这些缓存，所以帧缓存不是一片缓存，而是所有这些缓存的组合，帧缓存它对应了屏幕上的每一个pixel（不是真正的pixel，而是一个fragment所对应的位置）的各种这些信息（颜色、ZBUFFER、等等），几何体的fragment时没有帧缓存的，帧缓存时屏幕上的，一个缓存的一位就对应一个位片面。 Colorbuffer是最终
OpenGL系列教程之十一：OpenGL网格化
10-22 9458
网格化是将凹多边形或有边相交的多边形划分成凸多边形。由于openGL渲染时只接受凸多边形，这些非凸多边形在渲染之前必须先被网格化。 第一行中第一个图形是4条边的凹多边形，第二个图形中间有个洞，第三个图形有相交的边 下载：tessellation.zip，stencilTest.zip 概述 网格化基本的步骤是将所有非凸多边形的顶点坐标
WPF【11_4】WPF实战-重构与美化(MVVM 架构)
keke10的专栏
05-27 802
点击刷新， UI 则会通过发送事件的方式通知视图模型，而视图模型在收到刷新请求以后，就会去数据库提取数据，然后重新把数据提供给视图。最后，视图与模型之间由于加入了视图模型，所以产生了系统的分层，而数据也得到了有效的隔离，它们之间则是一个间接引用的关系。虽然对于一个 WPF 项目来说，仅仅使用 Model 和 View， 甚至只使用 View 也能完成各种各样复杂的功能，比如说上一章我们的实战项目只有 View， 同样也可以完成客户预约系统的开发。而视图模型作为业务逻辑的载体，也会承担与数数据库的沟通工作。
springboot--实战--大事件--用户接口开发
最新发布
m0_73856804的博客
05-27 1835
定义了一种简洁的、自包含的格式，用于通信双方以JSON数据格式安全的传输信息。组成：第一部分：Header（头），记录令牌类型、签名算法等。例如,算法用于防篡改第二部分：Payload（有效载荷），携带一些自定义信息，默认信息。例如。而外在表示为一段无规律的64个可打印字符原因：借助base64编码方式（Base64：是一种基于64个可打印字符（A-Z a-z 0-9 + /）来表示二进制数据的编码方式）来完成，将json字符串变为64个可打印字符，
21. 自动化测试框架开发之Excel配置文件的测试用例改造
Tom的专栏
05-20 1395
本文介绍了如何通过Excel配置文件实现自动化测试用例的改造。首先，测试框架的核心架构依赖于unittest、paramunittest、页面对象模型和Excel数据读取器。其次，通过ExcelReader加载Excel数据，支持参数化测试。测试用例参数化方案包括使用paramunittest和subTest，后者支持单测试方法管理多组数据，失败时继续执行后续用例。关键技术点包括数据驱动流程和异常处理机制，确保测试失败时自动截图并保留异常堆栈。Excel数据规范要求第一行为标题行，列名与代码参数对应。工程实
SpringMVC（结合源码浅析工作流程）
weixin_45865163的博客
05-23 852
Spring MVC是基于前端控制器（）设计模式的 Web 框架，在 Web 应用中指一个统一的入口，用来接收所有客户端请求，并统一进行分发、处理。在SpringMVC中，前端控制器就是Controller。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值