004: VTK读入数据---vtkImageData详细说明

VTK医学图像处理---vtkImageData类

目录

VTK医学图像处理---vtkImageData类

简介：

1 Mricro软件的安装和使用

(1) Mricro安装

(2) Mricro转换DICOM为裸数据 

2 从硬盘读取数据到vtkImageData

3 vtkImageData转RGB或RGBA格式

4 练习

总结

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简介：

        对于医学图像来说，vtkImageData是使用频率非常高的类，因为医学图像通常为较为规则的矩形或容积类型（三维），而vtkImageData类主要就是用于存储此类数据的，vtk中相关算法（比如阈值、缩放等）的输入和输出也是vtkImageData类，熟练掌握vtkImageData类非常重要。

        vtkDICOMImageReader类读取文件夹中的DICOM文件后，DICOM数据也存储在vtkImageData类中，本篇博文将跳过vtkDICOMImageReader类，直接从硬盘读取数据到vtkImageData类中，以增强大家对vtkImageData类的熟悉。

        由于DICOM格式非常负责，有专门的开源库对DICOM文件进行解析，比如DCMTK(DCMTK - dicom.offis.de)，我们不打算详细介绍DICOM标准，因此我们将借助一个免费的软件Mricro（建议大家学会使用给软件，不管是开发还是做科研都非常有用）来将DICOM文件转换为原始数据，采用C语言从硬盘读取原始数据到vtkImageData类中。

        本博文主要包括为 Mricro的安装和使用，从硬盘读取数据到vtkImageData类，vtkImageData类的详细介绍。

1 Mricro软件的安装和使用

下载地址：MRIcro software guide (sc.edu)   

打开网页后，点击下图中红色方框中的链接开始下载。

(1) Mricro安装

下载后，解压会看到下面的图标，双击安装，提出是否安装，选择是，一路默认安装，详细步骤如下图：

(2) Mricro转换DICOM为裸数据 

 在开始栏中搜索Mricro，或从所有应用程序里面找到Mricro启动，启动后的界面为：

DICOM数据下载地址：【免费】VTK-医学图像处理博文中需要的DICOM测试数据资源-优快云文库

下载DICOM数据解压，在Mricro软件的菜单项中选择 Import--Convert foreign to Analyze，跳出选择对话框。

在Number of Files中要输入待转换的DICOM文件张数， 例如这里我们转换10张，就在该输入框内填写10，记得勾选 Open sequential files:ignore filename选项，然后点击  Select。