4、优化瓦片浓度以减少误差和时间：DNA 分子电路新进展

优化瓦片浓度以减少误差和时间：DNA 分子电路新进展

在分子计算和自组装领域，瓦片系统的优化对于减少误差和提高组装效率至关重要。下面将深入探讨瓦片浓度优化相关的研究，以及基于 DNA 链置换的分子电路设计。

瓦片系统模拟结果

为了确定不同瓦片浓度下的误差率，研究人员使用了 Erik Winfree 实验室开发的 xgrow 软件对四个瓦片系统（A1、A2、B1 和 B2）进行了模拟。这四个系统都在 τ = 2 的条件下运行，除了种子结构外，仅包含两种瓦片 X 和 Y。

• 系统参数设置 ：
  • A1 和 A2 的种子结构长度调整为使得终端组装中 X 和 Y 出现的位置数 NX : NY 分别为 25 : 1 和 64 : 1。
  • B1 和 B2 的种子结构也做了类似调整，NX : NY 同样分别为 25 : 1 和 64 : 1。
• 模拟结果与理论预测对比 ：
  • 定理 1 预测，A1 和 B1 系统在 cX : cY = 5 : 1 时生长误差率最小，A2 和 B2 系统在 cX : cY = 8 : 1 时最小。
  • 但实际模拟结果显示，A1 和 A2 系统的最优瓦片浓度比分别为 2.5 : 1 和 3 : 1，B1 和 B2 系统分别约为 7.5 : 1 和 15 : 1。

系统	理论预测最优