AutoDock 设置柔性残基时闪退

最新推荐文章于 2025-06-09 14:17:07 发布
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问题

解决方法

解决步骤

        1.卸载1.5.7版本的MGLTools

        2.重新下载并安装1.5.6版本的MGLTools

问题

        AutoDock点击choose torsions in currently selected residues后闪退

解决方法

        卸载1.5.7版本的MGLTools，重新安装1.5.6版本

解决步骤

        1.卸载1.5.7版本的MGLTools

                找到MGLTools的安装路径，点击uninstall.exe

        2.重新下载并安装1.5.6版本的MGLTools

                下载链接：https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/

AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题
weixin_42628449的博客
05-02 3万+
AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题AutoDockTools安装AutoDock安装检查ADT闪退问题解决方案 如题，之前我万万没想到会遇到闪退问题，是我一位同学遇到的，于是顺便把安装教程一起写了。考虑到生物系的小伙伴主要是电脑小白，一水的windows，我这里用win10系统进行讲解。使用其他系统的小伙伴参考着自己研究一下也能搞定，我就不讲那么细了（用其他系统的肯定自己有本...
CADD课程学习（7）-- 模拟靶点和小分子相互作用 （柔性对接 AutoDock）
发呆的比目鱼的博客
07-05 723
CADD课程学习（7）-- 模拟靶点和小分子相互作用 （柔性对接 AutoDock）
AutodockTools
09-15
用于模拟，与autodock一起可以做打分子与小分子docking
Windows系统 解决AutoDockTools闪退问题
最新发布
分享各类领域技术问题
06-09 219
但是此时电脑的分辨率会大受影响，最好用完该软件重新启用该显卡哦~
windows系统解决Autodock打不开闪退的问题
wuyushengchina的博客
06-03 6633
在做实验的时候，要使用Autodock这个软件（虽然这软件有点老）。到网上随便找了个安装教程，安装完autodock、autodock_vida、mgltools后，桌面也创建了快捷方式。然后点击下图红框的autodock时，loading加载在10%左右不动，然后程序加载页面连同控制台一同闪退。下面来讲讲如何解决闪退问题。
AutoDock 安装后打开闪退问题 AutoDock分子对接 AutoGrid 报错 对接盒子配置 不能生成map文件的解决方法
GHZ2443063059的博客
05-10 1万+
AutoDock 安装问题 闪退问题
autodock使用时闪退
weixin_71090366的博客
05-27 3701
运行adt时弹出以下界面，摁下enter后就闪退，该怎么解决？
autodock安装后闪退怎么解决?
weixin_53380949的博客
11-16 1723
1. 首先进入到自己的显示卡界面， 看下自己的显卡是amd吗，如果是的话就需要切换成其他显卡，或者就是。没有影响，如果打游戏的话可以再打开。2. 禁用amd显卡有什么影响？
AutoDock-GPU：适用于GPU和其他加速器的AutoDock
02-21
AutoDock-GPU：适用于GPU和其他加速器的AutoDock 关于 OpenCL和Cuda加速版的AutoDock4.2.6。 它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。 OpenCL版本是与TU-Darmstadt合作开发的，...
AutoDock+MGLtools1.5.6-windows版.rar
05-19
3. **对接参数设置**：用户可以通过GUI设置AutoDock的参数，如搜索空间、算法参数、能量评估选项等。 4. **结果分析**：运行对接后，MGLTools可以帮助分析结果，如生成对接位点的热点图、计算结合自由能等。 在实际...
Autodock Vina 批量分子对接
08-26
4. 修改vina.sh脚本，设置环境变量，确保Autodock Vina和MGLTools的路径被添加到PATH中。 5. 使用prepare_receptor4.py和prepare_ligand4.py脚本预处理受体和配体分子，将其转化为Autodock Vina可读的格式。 6. 使用...
AutoDockTools安装包 mgltools-Linux-x86-64-1.5.6-install
07-08
安装时可以根据这位大佬的帖子进行https://blog.youkuaiyun.com/carlos_zhao/article/details/122718116?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522168879606616800213012204%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&request_id=168879606616800213012204&biz_id=0&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2~all~first_rank_ecpm_v1~rank_v31_ecpm-2-122718116-null-null.142^v88^control_2,239^v2^insert_chatgpt&utm_term=autodocktools1.5.6%20%E5%AE%89%E8%A3%85&spm=1018.2226.3001.41
AutoDock 分子对接Map文件闪退出错 Run AutoGrid报错 Run AutoGrid生成不了map文件 AutoDock 中Run AutoGrid操作生成map文件为0KB
GHZ2443063059的博客
02-29 2316
在AutoDock的对接里，打开AutoDockTools以后，一般分为两大步骤，map文件生成前的预处理和对接盒子配置以及map文件生成后的核心对接配置！！！！这就是典型的Run AutoGrid操作生成map文件失败：AutoDockMap出错。
AutoDock对接的局限性 蛋白对接蛋白 蛋白对接核酸 分子对接 AutoDock闪退 闪退核心问题解答
GHZ2443063059的博客
08-02 3085
根据已知的生物学信息或实验数据，定义主动（active）和被动（passive）残基。这些残基会在对接过程中作为可能的相互作用位点。主动残基通常是已知的结合位点或重要功能区域。被动残基是靠近主动残基并可能参与相互作用的区域。
AutoDock进行柔性分子对接教程
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duwenyi2017的博客
10-28 1万+
Autodock 柔性分子对接教程 First release：2018-9-22 Last update: 2018-9-22 四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！ Autodock是一款分子对接软件包，开源且免费，官方网址是http://autodock.scripps.edu/，目前最新的版本是AutoDock 4....
关于MGLTools打开闪退的问题
weixin_45626773的博客
11-28 707
电脑是锐龙处理器，设置的锐龙核显输出，然后在桌面设置ADT安装包里的python为N卡，打开正常。怀疑是ADT老版本和锐龙的兼容性问题。安装的时候也报错，新下载了搜狗输入法，把搜狗输入法切换成默认的微软键盘，安装正常。注意：安装路径不要有中文和空格。
lightroom 闪退_最近Autodesk软件全部闪退的解决办法
weixin_39667797的博客
11-03 4755
现在正常更新系统，已经不会出现我之前闪退的情况了。Windows与Autodesk又是一派和谐相处，共同繁荣的温柔场景。===========================================================================================不知道大家是不是也遇到了这样的情况win10系统，最近Autodesk的软件，Revit，Civi...
SailVina 使用教程 Autodock Vina分子对接全套整合软件 MGLTools闪退 作用力分析 MOE 薛定谔 Gromacs 全网最全分子对接教程
GHZ2443063059的博客
08-11 7622
SailVina只是一个带界面的脚本，批量调用Autodock Vina，openbabel等来便捷的进行分子对接。下载受体；自动准备受体。配体格式转换；根据取代基批量生成配体。验证对接方案(Protocol)是否可以还原实验结果。单个/多个配体和单个/多个受体进行对接。将对接的多个配体提取出来。提取对接的分数；批量提取分数，并选择性的提取结果。将配体和受体合并成一个文件。计算两个/多个小分子之间的RMSD值。
autodock launch闪退
03-24
### Autodock 启动时闪退的原因分析与解决方案 当遇到 AutoDock 软件启动时发生崩溃的情况，可能由多种原因引起。以下是可能导致此问题的因素以及相应的解决方法： #### 1. **软件版本兼容性** 如果使用的操作系统或图形驱动程序与当前安装的 AutoDock 版本不兼容，则可能会导致启动失败[^2]。 - 解决方案：确认所用的操作系统和显卡驱动是否支持该版本的 AutoDock。尝试更新到最新版的 AutoDock 或回滚至更稳定的旧版本。 #### 2. **依赖库缺失** AutoDock 的正常运行通常需要特定的动态链接库 (DLLs) 和其他外部依赖项。缺少这些文件会引发启动错误[^3]。 - 解决方案：重新下载并安装官方发布的完整包，或者手动检查是否存在所需的 DLL 文件及其路径配置是否正确。 #### 3. **环境变量设置不当** 某些情况下，未正确定义 PATH 变量或其他必要的环境参数也会阻止应用程序加载成功[^4]。 - 解决方案：验证所有必需的目录已被加入系统的环境变量列表中；必要时可查阅文档调整具体值。 #### 4. **硬件资源不足** 对于复杂分子建模任务而言，计算机内存(RAM)容量过低可能是另一个常见障碍之一[^5]。 - 解决方案：关闭不必要的后台进程释放更多可用RAM空间后再试一次操作; 如果仍然存在问题考虑升级物理设备规格来满足最低需求标准. #### 示例修复脚本 下面提供一段简单的 Python 脚本来帮助检测部分上述提到的问题: ```python import os import sys def check_env(): required_libraries = ['libGL.so', 'libXext.so'] # Example libraries needed for graphical applications. missing_libs = [] for lib in required_libraries: if not any(lib in path for path in os.environ['PATH'].split(os.pathsep)): missing_libs.append(lib) if missing_libs: print(f"The following libraries are missing: {missing_libs}") return False try: import OpenGL.GL as gl except ImportError: print("OpenGL library is not installed or improperly configured.") return False return True if __name__ == "__main__": status = check_env() if not status: sys.exit(1) ```
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