基因相关性——字符串入门

DNA序列比对

题目概要:

        为了获知基因序列在功能和结构上的相似性,经常需要将几条不同序列的DNA进行比对,以判断该比对的DNA是否具有相关性。

        现比对两条长度相同的DNA序列。首先定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对,如果一个碱基对中的两个碱基相同的话,则称为相同碱基对。接着计算相同碱基对占总碱基对数量的比例,如果该比例大于等于给定阈值时则判定该两条DNA序列是相关的,否则不相关。

输入:

        有三行,第一行是用来判定出两条DNA序列是否相关的阈值,随后2行是两条DNA序列(长度不大于500)。

输出:

        若两条DNA序列相关,则输出“yes”,否则输出“no”。

题目分析:

        加入两个字符一样则作++,后对比两个浮点数(++次数/字符串数和前面输入的小数),然后再根据题意输出。

代码实现:

#include<bits/stdc++.h>
using namespace std;
int main(){
	double k,a;
	string b,c;
	int l,s=0;
	cin>>k>>b>>c;//输入
	l=b.length();//求字符b和c的长度
	for(int i=0;i<=l-1;i++)//将所有字符进行比较
		if(b[i]==c[i]) s++;//字符相同及做++
	if(s*1.0/l>k) cout<<"yes";//大于的情况
	else cout<<"no";//小于的情况
	return 0;
}

输入样例:

0.85
ATCGCCGTAAGTAACGGTTTTAAATAGGCC
ATCGCCGGAAGTAACGGTCTTAAATAGGCC

输出样例:yes

总结:

        思路较清晰,其中一点难度在于中间循环部分的实现,其余部分还是容易的。

### C++ 中实现基因相关性的字符数组方法 在 C++ 编程中,通过字符数组可以高效地解决与基因相关性的问题。以下是基于多个引用内容综合得出的一种解决方案。 #### 方法概述 为了判断两条 DNA 序列相关性,可以通过比较每一对对应的碱基来计算匹配率。具体来说: 1. **输入数据**:接收一个相似度阈值 `x` 两组 DNA 序列。 2. **逐位对比**:遍历两个字符串的每一位,记录相同的碱基数。 3. **计算比例**:将相同碱基的数量除以总长度得到匹配比例。 4. **输出结果**:如果该比例大于或等于给定的阈值,则输出 `"yes"`;否则输出 `"no"`。 下面是完整的代码实现以及解释: ```cpp #include <bits/stdc++.h> using namespace std; int main() { double x; char s1[510], s2[510]; // 输入部分 cin >> x >> s1 >> s2; int len = strlen(s1); // 获取DNA序列长度 [^1] int matchCount = 0; // 初始化计数器 // 对应位置逐一比较 for (int i = 0; i < len; i++) { if (s1[i] == s2[i]) { matchCount++; // 若当前位相等则累加到matchCount变量上 [^3] } } // 计算匹配比率并判定是否满足条件 if (((double)matchCount / len) >= x) { cout << "yes"; // 当匹配率达到设定标准时打印"yes" } else { cout << "no"; // 否则打印"no"[^5] } return 0; } ``` 此段代码实现了上述逻辑流程,并且能够正确处理样例测试情况下的输入输出需求[^4]。 #### 关键点解析 - 使用 `strlen()` 函数测量第一个字符串的实际长度作为循环上限,前提是已知两者具有相同尺寸的前提条件下操作有效[^1]。 - 循环内部采用简单的条件语句检测相应索引处字符的一致性状况,从而更新匹配次数统计量[^3]. - 最终依据所求得的比例数值同预设门限做大小关系评估决定最终反馈形式["yes"/"no"]. ---
评论 1
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值