基因家族分析①:甘蓝生物信息学分析材料储备

本文介绍了两个重要的植物基因组数据库——中国农业科学院蔬菜花卉研究所的甘蓝基因组数据库BRAD和拟南芥基因组数据库TAIR。同时,讲解了如何下载CDS、PEP和GFF3文件,并使用filezilla进行上传。还提到了tar和gz文件的解压方法,以及如何使用mv命令来重命名和移动文件。

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甘蓝基因组数据库brad:http://brassicadb.cn/#/  由中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武实验室负责。

拟南芥基因组数据库TAIR:https://www.arabidopsis.org/

下载cds,pep,gff3文件,并通过filezilla上传。

tar文件的解压:

tar -zxvf 文件名

gz文件的解压:

gunzip Brassica_oleracea_JZS_v2.gene.gff3.gz

将解压后的文件移动到目标文件夹中:

还能用mv文件修改文件名:

 

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