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原创 新冠(covid19)完整测序流程(java调用docker容器方式实现,算法为nextclade和pangolin)
本地部署nextclade作为进化枝分配、突变检出和序列质量分析(数据集为新冠的数据集,可根据不同的数据集进行,不同病毒的相关分析)_nextclade安装下载-优快云博客。逻辑:序列添加成功后,发送消息到任务模块,任务模块监听到消息,通过docker工具类调用算法获取结果进行封装。docker-compose(一键部署配置文件)_docker compose 配置文件-优快云博客。本地部署pangolin获取谱系,从而达到预测新冠的流行趋势-优快云博客。
2025-04-04 02:55:45
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原创 本地部署pangolin获取谱系,从而达到预测新冠的流行趋势
data/input/input.fasta # 输入文件位置参数。-v $(pwd)/pangolin/input:/data/input \ # 挂载本地输入目录。-v $(pwd)/pangolin/output:/data/output \ # 挂载本地输出目录。-v $(pwd)/pangolin/dataset:/data/datadir\ # 挂载数据集版本。注:如要整合进系统,可通过shell命令进行调用,入库。
2025-03-05 22:47:46
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原创 本地部署nextclade作为进化枝分配、突变检出和序列质量分析(数据集为新冠的数据集,可根据不同的数据集进行,不同病毒的相关分析)
注:SARS-CoV-2为新冠的数据集,可下载不同数据集进行不同病毒的分析注:运行前请保证 nextclade/input目录下存在对应的序列文件,且数据集正确加载到nextclade/dataset目录下相关注释:-v $(pwd)/nextclade/input:/data/input \ # 挂载本地输入目录-v $(pwd)/nextclade/dataset:/data/dataset \ # 挂载数据集版本。
2025-03-02 18:22:42
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原创 (亲测通过unzipit方式获取4G的.zip文件后缀,校验格式正确方法)
【代码】(亲测通过unzipit方式获取4G的.zip文件后缀,校验格式正确方法)
2025-02-26 00:32:12
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原创 DeepSeek Window本地私有化部署
最近大火的国产AI大模型Deepseek大家应该都不陌生。除了在手机上安装APP或通过官网在线体验,其实我们完全可以在Windows电脑上进行本地部署,从而带来更加便捷的使用体验。之前也提到过,本地部署AI模型有很多好处,比如:隐私安全——所有数据都保存在本地,不用担心泄露敏感信息;响应速度快——官方或第三方服务由于访问量大,常常会导致卡顿,而本地部署能避免这种延迟问题。要在本地部署DeepSeek R1大模型并不难,只需安装开源工具Ollama,它可以支持各种AI模型的运行。
2025-02-09 21:30:38
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原创 ollama部署教程
模型文件存放目录,默认目录为当前用户目录(Windows 目录:C:\Users%username%.ollama\models,MacOS 目录:~/.ollama/models,Linux 目录:/usr/share/ollama/.ollama/models),如果是 Windows 系统建议修改(如:D:\OllamaModels),避免 C 盘空间吃紧。主机的/home/ollama文件夹映射到容器的/root/.ollama文件夹。ollama create # 从模型文件创建模型。
2025-02-09 20:38:51
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原创 MyBatis-Plus分页拦截器,源码的重构(重构total总数的计算逻辑)
【代码】MyBatis-Plus分页拦截器,源码的重构(重构total总数的计算逻辑)
2024-12-22 11:56:47
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原创 java线程池(直接复制用就行,参数已进行调配)
Executors.defaultThreadFactory(), // 线程工厂 (默认,无特殊需求都为默认)Runtime.getRuntime().availableProcessors()*2-1, // 最大线程数。Runtime.getRuntime().availableProcessors()-1, // 核心线程数。* 核心线程为 基础线程数 2n-1。* 基础线程数为 cpu 2n-1。
2024-12-22 11:37:10
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原创 ES(elasticsearch)整合Spring boot使用实例
【代码】ES(elasticsearch)整合Spring boot使用实例。
2024-12-08 14:23:03
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原创 docker部署elasticsearch(内涵集群部署的compose文件)
在互联网项目中,在网络间传输的速度很快,所以很多语言是不允许在网络上传递的,如:关于宗教、政治等敏感词语,那么我们在搜索时也应该忽略当前词汇。获取ik.zip包后,进行解压得到ik放入/var/lib/docker/volumes/es-plugins/_data路径下。--用户可以在这里配置自己的扩展停止词字典 *** 添加停用词词典-->IK分词器也提供了强大的停用词功能,让我们在索引时就直接忽略当前的停用词汇表中的内容。--用户可以在这里配置自己的扩展字典 *** 添加扩展词典-->
2024-12-04 20:06:24
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原创 Docker安装RabbitMq详细教程
1.7进行容器后,执行以下命令,开启web权限后,即可访问成功。1.1通过Docker pull RabbitMq。1.5通过IP加默认端口进行访问(15672)1.6如果访问不失败执行以下命令进行容器。地址:(IP+默认端口15672)1.4查看容器是否启动成功。1.3运行命令启动参数。
2024-11-20 23:45:59
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原创 docker-compose(一键部署配置文件)
tip:如果重启了服务器,可能有些容器会启动失败。所有程序都可运行成功,并且不会丢失数据。暴露5672和15672端口。单密码模式:123456。默认utf8mb4字符集。持久化数据到MySQL。你的ip:15672。nacos配套数据库。你的ip:13306。
2024-11-19 23:12:20
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原创 Java实现分片上传(前端分,后端合并)
throw new ServiceException("时间:{}" + new Date() + "文件名称:{}" + fileName + "上传失败");log.info("时间:{}" + new Date() + "文件名称:{}" + vo.getFileName() + "上传成功");log.info("时间:{}" + new Date() + "文件名称:{}" + vo.getFileName() + "上传失败");* @param chunkIndex 切片索引。
2024-04-22 20:58:09
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原创 SpringBoot框架接口数据加密(base64)传输(前后分离版本)
1.3 修改若依系统的request.js中的request拦截器-对config.data进行加密处理。记录技术,留下痕迹。如果有什么不合适的地方,请各位大佬留言指出,小弟改进!系统的request.js中引入base64。
2023-12-14 09:38:33
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空空如也
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