weixin_48076899的博客

但是实际中并不存在该目录。尝试用conda安装R。

使用2024年新版UNITE10在QIIME2中对真菌进行注释。

解决Bugbase的报错与输入文件

QIIME2-单端数据Deblur笔记记录

如果使用deblur-16S，deblur执行初始的正向过滤步骤，其中它丢弃与85% GreenGenes 数据库中OTU的序列小于60%相似性的任何序列。请注意，deblur接受合并的序列，并将它们视为单端序列，因此如果使用deblur进行去噪，需要先合并读取。Deblur使用序列错误配置文件将错误的序列与从其来源的真实生物序列相关联，从而得到高质量的序列变异数据，主要为两个步骤。stats-dada2.qza质控、去噪、去嵌合体后剩下的序列文件#查看每个样品剩余有效序列数（丰度表）

手把手操作——在QIIME2中使用UNITE9.0数据库

用于物种分类的软件或插件叫“分类器”，这些分类器因为采用了机器学习原理，在正式用于你的数据分类前必须训练这些分类器，以便让软件“学会”哪些特征可以最好地区分每个分类组。参考[2]注1：训练分类器需要用到特定的物种分类数据库（比如Greengenes database）和你自己测序时的引物序列，训练步骤是：先用引物定位Greengenes中的参考序列，然后截取出这些参考序列（截取出的参考序列长度和你测序获得的序列长度类似），然后把这些序列与物种分类名称匹配，这样就获得了“分类器”。要么用上面两个为一套。

在服务器或本地离线安装QIIME2