最新解决从github上安装CellChat失败的问题20240505

项目场景：

提示：这里简述项目相关背景：

医学生，自学数据分析，现在学习单细胞，遇到安装解决从github上安装CellChat失败的问题

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问题描述

提示：这里描述项目中遇到的问题：

目前各种帖子都有各种报错：
1.有的是依赖的包未能提前安装， 多以Biobase, BiocNeighbors, BiocGenerics, ComplexHeatmap，NMF为主，尝试提前安装过后仍然不行。
2.devtools::install_github(“sqjin/CellChat”)也是报错，
Downloading GitHub repo sqjin/CellChat@HEAD
Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, :
download from ‘https://api.github.com/repos/sqjin/CellChat/tarball/HEAD’ failed
3.上述2的问题多以网速卡顿导致，多试几次也可以下载，但是还有可能报错如下：
警告信息:
In i.p(…) :
安装程序包‘C:/Users/zhixu/AppData/Local/Temp/RtmpywdAwF/file5ce83d7e7f90/CellChat_1.6.1.tar.gz’时退出狀態的值不是0

原因分析：

可以求助chatgpt

解决方案：

目前cellchat包升级，更新后的下载方式为：
devtools::install_github(“jinworks/CellChat”)
同样的遇到网速问题，多耐心点击等待，需要安装依赖包就安装。另外新电脑或更新了R版本还可能报错
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