分享一个基因功能富集的网站——geneontology

上次提到一个好用的基因功能富集网站——DAVID：

分享一个基因功能富集的网站——DAVID_Lijingxian教你学生信的博客-优快云博客基因富集分析是在一组基因中找到具有一定基因功能特征和生物过程的基因集的分析方法，在研究差异表达基因、筛选基因的后续分析中经常使用。富集分析能够发现在生物学过程中起关键作用的生物通路, 并且帮助理解生物学过程的分子机制。它是快速调查目标基因集功能倾向性的方法之一。进行基因功能富集的网站很多，下面我们先介绍其中一个，叫DAVID。这个网站目前用中国的百度似乎搜索不到了，我们可以用谷歌搜索一下：...https://blog.youkuaiyun.com/weixin_46500027/article/details/124216167?spm=1001.2014.3001.5501今天我们讲一下geneontology，这也是一个功能富集网站，网址如下：

Gene Ontology Resource

我们先看看界面：

 

左下角可以查询基因或者某个功能富集项目：

 右边则是和DAVID一样的输入一串基因，然后选择想要富集的项目和物种，点击lauch即可：

 

 

例如我们使用网站提供的example：

 

选择生物学过程和人类：

 可以得到如上结果：

这个网站的好处就是，不像DAVID一样，得新建一个txt文本文档，然后复制所有结果粘贴进去，再用Excel打开，我们可以直接点击上方的文件下载下来：

 

 然后用excel打开：

 或者直接点击全选粘贴到Excel里面：

 如果要看某个富集项目里面有哪个基因，可以点看红框的来看：

 但是在下载的Excel里面看不到每个项目富集的基因，DAVID可以看，因此每个网站各有各的弊端吧。