解决【scVelo】Error: Neighbors.compute_neighbors() got an unexpected keyword argument write_knn_indices

前言

最近分析单细胞数据，发现自己环境中的scanpy 版本落后太多了，所以更新了一下……然后在做 RNA Velocity分析的时候遇见了报错： Error: Neighbors.compute_neighbors() got an unexpected keyword argument 'write_knn_indices'，记录一下解决过程。

报错场景

工具版本：Scanpy Version：1.10.1、ScVelo Version：0.3.2
代码：

import scvelo as scv
...
...
scv.pp.moments(adata,