seurat gene expression matrix基因表达矩阵数据

Seurat是一个用于单细胞转录组分析的R包。通过使用`pbmc[[“RNA”]]@counts`,你可以访问到活性检测(active assay)中的原始计数矩阵;而标准化后的基因表达矩阵则存储在`pbmc[[“RNA”]]@data`中。这篇内容介绍了如何操作Seurat对象来获取和分析单细胞数据的表达矩阵。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

seurat 表达矩阵访问

seurat有个active assay,它其中存的就是表达矩阵,用pbmc[[“RNA”]]@counts就可以访问

数据标准化后的基因表达矩阵放在:pbmc[[“RNA”]]@data

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