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RSS订阅原创 植物转录因子 ChIP-Seq 实战系列 - Motif 分析
植物转录因子 ChIP-Seq 实战系列 - Motif 分析欢迎使用Markdown编辑器你好！ 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Markdown编辑器, 可以仔细阅读这篇文章，了解一下Markdown的基本语法知识。新的改变我们对Markdown编辑器进行了一些功能拓展与语法支持，除了标准的Markdown编辑器功能，我们增加了如下几点新功能，帮助你用它写博客：全新的界面设计 ，将会带来全新的写作体验；在创作中心设置你喜爱的代码高亮样式，Mar
2020-05-25 10:08:04
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原创 植物转录因子 ChIP-Seq 实战系列 - Peaks基因组分布偏好性
植物转录因子 ChIP-Seq 实战系列 - Peaks基因组分布偏好性
2020-05-16 13:37:50
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原创 TACO - 使用cuffmerge进行转录本拼接时你可能还不知道你在犯错
在分析RNA-seq数据时，你经常可能会需要使用cufflink或stringtie两个软件进行转录组组装，用于预测新的转录本，这两个软件是RNA-seq分析中进行有参转录本组装的最最最常用到的软件了，同时他们也自带了工具（cuffmerge和stringtie -merge）用于将组装好的转录本进行拼接，经典分析流程基本上就是：tophat + cufflink + cuf...
2020-04-20 14:14:17
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原创 python txt文件的数据筛选
之前已经分享完python的数据类型和数据结构了，我认为掌握了这两方面内容其实已经具备使用python进行数据分析的能力了，但实际情况是你经常会发现你看了很多python的基础内容，而当你要使用时还是发现无从下手（哈哈，因为我一开始是这样），那是因为你缺少实战经验，实战才是学习掌握python的最快办法。所以要从零开始学习python，有目的的边查边写能够让你迅速掌握python。在整理写作过程中...
2020-04-19 18:12:20
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原创 序列比对原理
在生物信息学研究中，序列比对是一个非常基础的问题，在很多研究中都会用到。主要几种算法包括全局比对算法（Needleman-Wunsch算法），局部比对算法（Smith-Waterman 算法），Blast等。开展一个课题时难免要构建克隆，寻找同源蛋白等，那当你在使用 NTI , MEGA 等进行比对时，你了解过序列比对的原理吗？序列比对基本原理输入数据—— 序列 seq1，seq2，se...
2020-04-18 15:16:08
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原创 python 数据结构
数据结构是指以某种方式组合起来的数据元素集合，pyhton 最基本的数据结构为序列，序列的每个元素都有编号，即其位置或索引，其中第一个元素的索引为 0简单的序列如 hello wordpython 中最主要的几种数据结构为列表，元组和字典列表列表的表示方法为 [ ]，类似在 excel 新建一列值创建一个名为 x 的空列表x = []创建一个包含 1-5 (整数型) 的名称为 x ...
2020-04-18 15:12:48
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原创 python-数据类型
Pyhton 运行环境在使用 python 进行数据分析之前，你需要配置运行环境windows： pycharmlinux： IPython IPython 相比于 linux 系统自带的 python 更好用，它可以在 IPython 环境下直接进行 shell 命令的相关操作，省去了在 shell 和 python 之间的来回切换Python-数据类型在生物信息的学习过程中我发现除了...
2020-04-17 19:16:51
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空空如也
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