Warning: unable to access index for repository https://bioconductor.org/packages/3.17/

XH生信ML笔记

于 2023-05-21 21:06:09 发布

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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/weixin_44022515/article/details/130796669

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在将R更新至4.3.0后，尝试使用BiocManager安装GenomicFeatures包时遇到了无法访问Bioconductor仓库中特定平台二进制版本的问题。由于缺少big-sur的预编译版本，解决方案是通过指定type=source来从源代码安装大部分包。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

最近将r升级到4.3.0，使用biomanager安装enomicFeatures包时出现无法访问index的问题

BiocManager::install("GenomicFeatures")
'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see
'help("repositories", package = "BiocManager")' for details.
Replacement repositories:
    CRAN: https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/
Bioconductor version 3.17

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