linux的gromacs模拟分子运动,gromacs的拉伸往复运动

最新推荐文章于 2025-06-12 08:21:11 发布
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#linux的gromacs模拟分子运动

该博客详细介绍了如何在Linux环境下利用gromacs进行分子动力学模拟，重点讲解了设置拉伸往复运动的参数，包括温度耦合、约束算法和拉伸模拟的核心部分。

; VARIOUS PREPROCESSING OPTIONS =

title                    = Martini

cpp                      = /usr/bin/cpp

; RUN CONTROL PARAMETERS =

integrator               = md

; start time and timestep in ps =

tinit                    = 0.0

dt                       = 0.020

nsteps                   = 100000 ;2ns

; OUTPUT CONTROL OPTIONS =

; Output frequency for coords (x), velocities (v) and forces (f) =

nstxout                 &n

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