英伟达深度学习学院GAN项目的脑图预处理
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前言
在进行英伟达GAN实验中预处理的整个流程进行总结
一、对源图进行MNI 模板的转化
为什么要对源图像进行MNI模板的配准,因为如果没有对源图配准则在进行图像分割时会出现错误,错误为没有足够空间,需要你检查一下照片。
使用DiffusionKit软件对源图像进行MNI模板配准。将源图像nii文件以及MNI152模板放到D:\Destination Folder文件夹中。打开cmd,cd指令进入D:\Destination Folder文件夹中。运行代码后会生成一个outputresult.nii的结果文件,这个便是MNI配准后的源图像。
二、利用matlab的spm12中的cat12插件对源图MNI进行分割处理
启动matlab->spm->cat12->Segment->Volumes(选中之前的outputResult.nii)->启动按钮
Split job into separate processes这个选项是多任务处理,可以查看你的计算机是几个核的,然后同时处理多个nii图像。
Voxel size for normalized images这个选项是与源图的像素比例,我们修改为1.5。若改为1则会出现,源图切分有120张切片,而分割后为180张切片。会不匹配,对后续的实验造成不便。
分割结束后会产生几个文件,其中mri文件存放了分割后的各图像,我们选取需要的图像进行切片。使用MRIcron软件进行查看。