如何用clustalx做序列同源比对后的结果图
我自己编辑了后的序列后辍名是.seq和.fas 都不能在软件中打开,为什么? 多序列比对的原理以及clustal在多序列比对中的应用内容提要•多序列比对的意义•多序列比对的方法•自动多序列比对的算法•Clustalx的使用(clustal法)•实例分析序列相似性比较和序列同源性分析序列相似性比较:就是
clustalx 多重序列比对 需要切整齐吗
使用mega5,对已知的多重序列制作系统进化树——NJ图和MP图。 邻接距离矩阵法( NJ)在系统发育树构建中应用最为广泛,可以较快的构建系统树,同时也比较适合于分析较大的数据集,并可以很快地进行自展检验,但缺点是分析的进化距离不能太大。
如何用clustalx做序列同源比对后的结果图MegAlign,ClustalX和MUSCLE三种方法的结果基本相似,差异不大。MegAlign,ClustalX和MUSCLE都属于多序列比对的方法,ClustalX用的是累进算法进行比对,MUSCLE用的是迭代方法进行比对运算, MegAlign是累进和迭带都可以用。累进算法将最接近的序。
1. Clustalx是多条序列比对软件,为什么需要设置两举例: A、B、C三条序列比对。 其实就是 A和B比 A和C比 B和C比 同理n条多序列比对就是做nC2次两序列比对,因此多序列比对的本质就是多次两条序列比对,也就是某条序列和其余的各个序列都进行一次比对。那么参数的设置当然就是设置两条序列比对时
如何进行多序列比对,结果用来发文章的那种。
clustalx比对前如何去掉沉余序列
一条染色体上出现一个基因的很多复份(复本)。例如,黑腹果蝇的核仁形成中心就拥有一个基因的几百个复份,控制着rRNA分子的18S和28S组分。 是否“冗余”,一个很重要的问题是时空尺度以及“冗余”所指向的对象(对谁和哪个功能或过程冗余)。
MegAlign,ClustalX和MUSCLE三种方法的结果是否存在MegAlign,ClustalX和MUSCLE三种方法的结果基本相似,差异不大。MegAlign,ClustalX和MUSCLE都属于多序列比对的方法,ClustalX用的是累进算法进行比对,MUSCLE用的是迭代方法进行比对运算, MegAlign是累进和迭带都可以用。
同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?
一本科菜鸟CSS布局HTML小编今天和大家分享助,哪位大侠伸出援手: 我想对植物中的一种酶基因做一个聚你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因(ortholog)然后再做进化树那种吧。进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequence alignment。