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RSS订阅原创 分子对接时，如何确定是自己需要的蛋白？
第三点中，分辨率高（也就是Resolution数值<2）的，但同时一定要优先级考虑共晶配体，再去考虑分辨率。PDB中对共晶配体结构记录较为详细，一般一些很小的分子，数量很多分子，结合在很浅的蛋白表面的分子通常不会是配体分子。名称常见的GOL、ACT、PEG、SO4，这些知识蛋白结晶所需要的或者在溶液中存在的分子，不是真正意义上的配体小分子。以蛋白4UMX为例，PDB查询结果如下，得出VVS是结合位置的对接口袋。（常见的辅酶还有ADP、ATP、NAD+、NADH、NADP+、NADPH、HEME。
2024-09-11 20:44:20
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空空如也
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