install_github安装错误解决方法

最新推荐文章于 2025-05-15 11:48:26 发布
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本文记录了使用devtools从GitHub安装clonevol R包的过程。初次尝试因超时失败，通过指定GitHub API主机地址的方式成功安装。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

install.packages('devtools')
library(devtools)
install_github('hdng/clonevol')

Installation failed: Timeout was reached

 

install_github('hdng/clonevol', host = "api.github.com")

successfully

 

npm install 报错 fatal: unable to connect to github.com 的解决方法
邓邓子的博客
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最新解决从github上安装CellChat失败的问题20240505
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医学生，自学数据分析，现在学习单细胞，遇到安装解决从github上安装CellChat失败的问题。
install_github无法安装 Rwebdriver包的解决方法
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08-03 499
1.通过install_githtb安装Rwebdriver包的错误如下： 提示不能打开URL，但是将URL地址输入浏览器地址栏，则可以下载包到本地 2.在网上搜索，发现可以通过本地文件来安装（install_github无法下载 R 包的变通方法），于是先将URL地址文件下载到本地，由于下载下来的是.tar.gz的压缩包，因此现将压缩包解压到D:\Program Files\R...
install_github报错：Failed to install ‘unknown package‘ from GitHub，API rate limit exceeded for...
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install_github报错：Failed to install 'unknown package' from GitHub，API rate limit exceeded for... Use `usethis::create_github_token()` to create a Personal Access Token. Use `usethis::edit_r_environ()` and add token as `GITHUB_PAT`
「DebugR」被install_github吐槽版本低不给通过安装该怎么办
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今天我用我的R3.6.1安装monocle3 remotes::install_github('cole-trapnell-lab/monocle3') 安装到一半的时候因为如下问题出现报错 Error: (converted from warning) package 'SummarizedExperiment' was built under R version 3.6.2 这个其实是因为...
一篇github基础教程，大手勿喷。看别人的。自己刚照着这个学会
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Python库 | pds_github_util-0.11.4.tar.gz
03-07
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PyPI 官网下载 | dagster_github-0.7.1rc0-py3-none-any.whl
02-08
在这个例子中，用户可以使用`pip install dagster_github-0.7.1rc0-py3-none-any.whl`命令来安装这个软件包。 2. **预发布版本（Release Candidate，RC）**：版本号中的"rc0"表示这是该版本的预发布版本，即Release...
在vscode中使用yarn install安装github项目报错
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github timeout 问题解决 与访问加速
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11-26 1221
github登录总是超时,非常影响体验，原因不是被github被限制了，而是github的DNS被污染了，可以通过手工设置DNS解析来处理。通过点击windows键，输入terminal, 右键选择“以管理员的方式运行”清理下本机的dna解析信息 参考博客github timeout 问题解决。录入上述github地址，保存并退出即可登录github了。如果仍然不好使，可以执行 cmd窗口执行。下载最新的github hosts文件。修改本地配置， 注意需要使用。windows管理员。
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最近在了解openmetadata，在ubuntu上安装好docker和docker compose后，在启动服务容器时，报出error get https://registry-1.docker.io/v2/的问题（如下图）直接修改yml文件里的image即可，如下。
R语言学习1—从github上安装包失败解决办法！
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这里你可能会遇到 如下错误：401错误，验证没通过的问题。
INSTALL_FAILED_VERSION_DOWNGRADE
小牧在一直在学习,在前进的道路上大家一起学习，进步。
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使用 adb install 安装apk 的时候出现的改问题, 说下处理方法: adb install -r -d xxx(路径) 这个是卸载之前的app 并安装新的app
devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR") 弹出的选项选哪个
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<think>我们正在处理用户关于使用devtools安装TwoSampleMR包时遇到弹出选项的问题。根据用户描述，安装过程中出现了需要用户选择的选项，但用户不确定如何选择。 参考引用信息： 引用[1]提供了安装TwoSampleMR的标准命令：`install.packages("devtools")` 和 `devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")`。 其他引用[2]-[5]主要讨论了安装过程中可能出现的错误和解决方法，但并没有直接提到安装TwoSampleMR时会出现选项选择。 然而，用户提到在安装过程中有“弹出选项”，这可能是由于安装过程中需要用户确认某些依赖包的安装，或者系统询问是否从源代码编译包等。 在R中，使用`install.packages`或`devtools::install_github`安装包时，可能会遇到以下需要用户交互的情况： 1. 当有多个版本的包可用时（比如二进制版本和源代码版本），可能会询问用户是否要安装二进制版本（如果可用）或从源代码编译。 2. 当安装依赖包时，可能会询问是否更新已安装的包（特别是当依赖包有更新版本时）。 3. 在某些系统（如Windows）上，可能会询问是否将包安装到个人库（如果系统库不可写）。 针对TwoSampleMR包，它可能有一些依赖包，在安装过程中可能会提示用户进行选择。 根据经验，常见的做法是： - 如果询问是否安装二进制包，通常选择“yes”安装二进制包（如果可用），因为这样通常更快且不需要编译工具。如果二进制包不可用或用户希望使用最新版本（可能只有源代码），则选择“no”以从源代码安装。 - 如果询问是否更新已安装的包，用户可以根据情况选择。如果不想更新，可以选择“no”；为了确保兼容性，通常建议更新（选择“yes”或“all”）。但有时更新大量包可能会引起其他问题，所以需要谨慎。 - 如果询问安装位置，通常选择个人库（用户有写入权限的位置）。 由于用户没有提供具体的选项内容，我们只能给出一般性建议。 但是，根据引用[1]的安装命令，我们可以尝试提供一种避免交互选择的方法，即通过设置参数来避免提示。 在`install_github`函数中，可以通过设置参数`upgrade = "never"`来避免更新已安装的包，或者设置`upgrade = "always"`来始终更新。另外，可以通过设置`type = "binary"`来优先选择二进制安装（如果可用）。 例如： ```r devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR", upgrade = "never", type = "binary") ``` 或者，如果用户希望更新所有依赖包： ```r devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR", upgrade = "always", type = "binary") ``` 另外，如果用户遇到的是关于编译代码的选项，那么可能需要确保系统具备编译工具（如Rtools for Windows，Xcode for Mac等）。如果用户没有编译工具，则应尽量选择二进制安装。 如果上述方法仍然不能避免弹出选项，用户可能需要根据具体提示进行选择。常见的选项选择建议： - 如果提示类似于“Do you want to install from sources the package which needs compilation?”，如果用户没有编译环境，应该选择“no”，然后尝试安装二进制版本。如果有编译环境，可以选择“yes”。 - 如果提示更新包，例如“Which would you like to update?”，可以选择“all”更新所有，或者“none”不更新，或者选择特定的包更新。为了顺利安装，通常建议更新所有依赖包（选择“all”或“CRAN packages only”等）。 由于用户没有提供具体的选项内容，我们只能提供这些一般性指导。 如果用户能提供具体的选项内容，我们可以给出更精确的建议。 另外，参考引用[2]-[5]中提到的一些安装问题，用户也可能遇到网络或API限制等问题，但用户当前的问题是关于选项选择，所以暂时不涉及。 因此，我们建议用户尝试使用参数设置来避免交互，或者根据上述常见情况选择。 如果问题仍然存在，请用户提供具体的选项提示信息。 最后，我们生成相关问题供用户进一步参考。</think>在使用 `devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")` 安装 TwoSampleMR 包时，常见的交互选项及选择建议如下： ### 常见选项及选择建议 1. **更新依赖包提示** ```r These packages have more recent versions available. Which would you like to update? ``` - **推荐选择**： - 若需最小化变动：输入 `3`（None）跳过更新 - 若需兼容性保障：输入 `2`（All CRAN packages）更新所有CRAN包 - 避免选择 `1`（Some）手动选择，易出错 2. **编译源代码确认** ```r Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/cancel) ``` - **推荐选择**： - Windows/Mac普通用户：输入 `no`（优先安装二进制预编译包） - 开发者/Linux用户：输入 `yes`（需提前安装编译工具链） 3. **安装路径确认** ```r Would you like to create a personal library to install packages? (Yes/no) ``` - **推荐选择**： - 无管理员权限时：输入 `yes`（安装到用户目录） - 有管理员权限时：输入 `no`（需配合sudo权限） ### 一键安装命令（避免交互） ```r # 强制二进制安装 + 跳过依赖更新 devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR", upgrade = "never", type = "binary") ``` - `upgrade = "never"`：禁止更新已安装包 - `type = "binary"`：强制使用预编译包（避免源码编译） ### 注意事项 1. 若遇网络错误（HTTP 403），需设置GitHub API令牌： ```r usethis::create_github_token() # 创建令牌 gitcreds::gitcreds_set() # 存储凭据 ``` 2. 安装前确保已配置编译环境： - Windows：安装 [Rtools](https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/) - Mac：安装 `Xcode Command Line Tools`（终端执行 `xcode-select --install`） ### 备用安装方案 若持续失败，采用本地安装： ```r # 1. 手动下载ZIP: https://github.com/MRCIEU/TwoSampleMR/archive/refs/heads/master.zip # 2. 本地安装 install.packages("path/to/TwoSampleMR-master.zip", repos = NULL, type = "source") ``` > 关键提示：**95%的安装问题可通过 `upgrade="never" + type="binary"` 参数解决**[^1][^5]。若仍遇选项弹窗，建议直接选择 `no`（不更新依赖）和 `no`（不编译源码）[^2][^4]。
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