SimpleITK学习(二)图像读取

本文介绍了如何使用SimpleITK库读取DICOM文件,包括单独的DICOM文件和一系列DICOM文件(CT图像)。内容涉及获取图像的基本信息如大小、像素间距、坐标原点和方向,以及元数据的存储方式。此外,还讲解了如何读取DICOM序列,获取三维矩阵数据,并强调了像素矩阵在训练模型中的重要性。

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通常我会用simpleitk来读取dicom文件,主要是为了将dicom文件转换为numpy矩阵,便于输入神经网络,读取dicom文件可分为两种情况,一.单独的dicom文件 二.一系列dicom文件,前者只是一张切片,通常是X光片,后者是很多张切片,合在一起通常代表CT图像。

一.

读取dicom文件

file = sitk.ReadImage(filepath)

获取基本信息,大小,像素间距,坐标原点,方向

file.GetSize()
file.GetOrigin()
file.GetSpacing()
file.GetDirection()

输出信息类似下面这样

还可以获取很多其它信息,这些信息以字典的形式存储,称为元数据

 

上面是字典的键,具体为什么是这种形式,还不太清楚

字典的值形式如下

上面输出的只是一小部分信息,利用microDicom软件打开一个dicom文件,可以看到详细的元信息

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