SimpleITK、Slicer读取图像信息

最新推荐文章于 2025-06-21 18:42:40 发布
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分类专栏： slicer
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/huihui__huihui/article/details/115526694
本文对比了SimpleITK和Slicer两种工具在读取图像文件时获取尺寸、原点、空间和方向信息的方法，并展示了它们在医疗图像处理中的应用。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

SimpleITK读取图像信息

image = sitk.ReadImage("/home/jack/test/T1.nrrd")
#图像的大小
iamge.GetSize()
#原点
image.GetOrigin()
#空间
image.GetSpacing()
#方向
image.GetDirection()

结果
在这里插入图片描述
  
Slicer读取图像信息

masterData=masterVolumeNode.GetImageData()
#masterData的类型是vtkImageData 
masterData.GetDimensions()
masterVolumeNode.SetDimensions()

masterData.GetSpacing()
masterVolumeNode.SetSpacing()

masterData.GetOrigin()
masterVolumeNode.SetOrigin()
使用SimpleITK学习图像读取
MhgCobol的博客
09-21 553
在本文中，我将向您展示如何使用SimpleITK库来读取图像数据，并提供相应的代码和描述。通过上述代码，我们可以轻松地使用SimpleITK来读取图像数据，并进行进一步的处理和分析。SimpleITK提供了许多其他功能，如图像滤波、分割、配准等，您可以根据自己的需求进一步探索。通过这个函数调用，我们将图像数据转换为NumPy数组，使得我们可以使用NumPy的功能对图像进行更复杂的操作。除了基本信息之外，我们还可以使用SimpleITK库提供的各种函数来进一步处理图像数据。接下来，我们可以使用。
可以使用Python中的SimpleITK库（sitk）来读取多个图像并将其存储在列表中。
WunApplescript的博客
09-21 828
这是一个简单的示例，它演示了如何使用sitk.ReadImage函数读取多个图像并将其存储在列表中。你可以根据自己的需求进一步扩展代码，并对读取的图像进行处理和分析。接下来，我们初始化了一个空的图像列表，然后使用一个循环遍历图像文件列表。在代码中，我们首先导入了SimpleITK库并引入了os模块，以便处理文件路径。然后，我们定义了图像文件夹的路径，并使用。然后，你可以使用sitk.ReadImage函数来读取每个图像，并将其存储在一个列表中。最后，我们将读取的图像添加到图像列表中。
SimpleITK——创建nrrd体素模型
最新发布
bianguanyue的博客
06-21 354
在介绍如何生成nrrd前，了解一下为什么医学影像上一般使用nrrd的体素模型？
SimpleITK学习（二）图像读取
weixin_30765577的博客
03-08 2834
通常我会用simpleitk来读取dicom文件，主要是为了将dicom文件转换为numpy矩阵，便于输入神经网络，读取dicom文件可分为两种情况，一.单独的dicom文件 二.一系列dicom文件，前者只是一张切片，通常是X光片，后者是很多张切片，合在一起通常代表CT图像。 一. 读取dicom文件 file = sitk.ReadImage(filepath) 获取基本信息，...
SimpleITK读取医学影像文件
我是托蜜的博客
06-12 7635
原文：https://blog.csdn.net/songchunxiao1991/article/details/79074604 SimpleITK ITK是一个开源、跨平台的框架，提供给开发者增强功能的图像分析和处理套件（推荐使用）。 Note:注意SimpleITK不支持中文，即路径中不能有中文 X射线图像对应的读取 import SimpleITK as sitk filename = ...
Ubuntu中python调用SimpleITK来显示图像
mjiansun的专栏
02-28 6272
转自：http://blog.csdn.net/jiandanjinxin/article/details/53232440 misc.imshowipython import os from scipy import misc dataDir = os.environ["HOME"] + "/Downloads/SimpleITK-MICCAI-2001-Tutorial-master/D
SimpleITK使用——5. dicom转nifti，获取dicom的meta信息
啷个哩个啷
09-28 741
记录一下
【SimpleITK 学习笔记】01安装与图像读写
NirReb的博客
05-19 3707
文章目录相关资料SimpleITK安装图像的物理坐标像素的类型图像生成图像简单读取图像属性（Basic Image Attributes）像素操作（Accessing Pixels and Slicing）SimpleITK 与 Numpy 转换SimpleITK2NumpyNumpy2SimpleITK图像读写DICOM 序列图像读写 相关资料 SimpleITK 官网 SimpleITK Jupyter notebook 教程 SimpleITK安装 pip install SimpleITK 其他安
读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像操作
09-16
SimpleITK的`GetDepth`方法可以获取图像的深度（层数），`GetSize`则返回图像的尺寸（宽、高、深）： ```python img = sitk.ReadImage(path) print(img.GetDepth()) # 输出图像的深度，如144 print(img.GetSize()) ...
SimpleITK使用——6. DICOM-RT格式转换为nii.gz格式
啷个哩个啷
04-26 1872
其实Github上有很多这样的库和脚本，但是都大同小异，掌握关键那部分代码就可以。 要明确一点，SimpleITK不支持对DICOM-RT struct格式 大部分脚本都是用pydicom读取，然后再用numpy等进行切片等操作。 1. 使用MIScnn库来完成转换 安装 sudo pip install miscnn # linux pip install miscnn --user # Windows 使用 from miscnn.data_loading.interfaces.dicom_io
读取并可视化DICOM图像（VTK & OpenCV）
06-21
本资源是将DICOM格式的CT图用VTK读取，转给OpenCV处理并可视化。当中的操作比普通的图片显示要更困难（可看我的博文了解）。本程序只要配置好OpenCV和VTK环境即可成功运行，使用简单方便。
SimpleITK使用——4. 奇怪的问题
啷个哩个啷
06-30 1603
numpy默认数据类型问题
SimpleITK学习
Kint的博客
03-22 1532
SimpleITK工具包入门学习
Slicer学习笔记（五十一）slicer python扩展中在3D视图显示信息
juluwangriyue的博客
03-21 1325
Slicer学习笔记（五十一）slicer python扩展中在3D视图显示信息1、Display text in a 3D view or slice view 1、Display text in a 3D view or slice view The easiest way to show information overlaid on a viewer is to use corner annotations. view=slicer.app.layoutManager().threeDWidget(
使用SimpleITK调用3D Slicer（其他Viewer操作相同）
Steven_Zhang_的博客
10-23 827
使用SimpleITK调用3D Slicer一、安装3D Slicer二、设置环境变量利用cmd设置环境变量进行测试 一、安装3D Slicer 二、设置环境变量 利用cmd设置环境变量 setx SITK_SHOW_COMMAND "C:\xxx\xxx\ImageJ\Slicer.exe" 以上path中为安装3D Slicer的地址，其他viewer也是同样操作。 【注】环境变量设置成功后会有提示。 进行测试 import SimpleITK as sitk img = sitk.ReadImage
3d slicer读取html图像,使用3D Slicer对图像进行配准(示例代码)
weixin_28943105的博客
06-18 558
在进行深度学习之前，我们需要图像进行一些预处理操作，其中配准是很重要的一环，以下将介绍使用软件3D Slicer来进行图像配准3D Slicer是(1)一个软件平台，用以图像分析(包括配准和实时编辑)，图像可视化以及图像引导治疗；(2)是一个免费、开源软件，并适用于Linux、MacOSX和windows操作系统；(3)拥有强大的可扩展性，可以通过模块嵌入方式来增加新的功能和应用。3D slice...
SimpleITK的IJK坐标和RAS坐标，长度，角度转化并将结果用于3DSlicer
william1205_的博客
04-03 797
在上一篇文章里提到SimpleITK和Slicer的R轴和A轴很有可能相反，那么必须在负号上做一些修改才能保证SimpleITK的计算结果在Slicer里能正确使用。基于这个原理，还可以写出在sitk中计算RAS长度和角度的函数（角的单位用度）IJK坐标和RAS坐标转化ras2ijk2ras.py。IJK转RAS是上面的逆过程。RAS转IJK一共3步。
Slicer学习笔记（五十三）slicer 数据转simpleITK数据
juluwangriyue的博客
03-24 1064
Slicer学习笔记（五十三）slicer 数据转simpleITK数据1、Running an ITK filter in Python using SimpleITK 1、Running an ITK filter in Python using SimpleITK inputImage = sitkUtils.PullVolumeFromSlicer(self.volume_node) print(inputImage) Image (00000265CB863CC0) RTTI typei
医学影像中的基础知识
qq_36717487的博客
01-25 3083
1.Hounsfield单位       不同密度的组织具有不同的衰减系数，CT诊断中为了对不同组织进行区分，将不同密度的各种组织用不同的CT值表示，称为Hounsfield单位(Hu)。       以水为0，空气为-1 000，致密骨为+1 000，这样CT将测得的信号高度精确地数字化，具有了很高的空间和密度分辨力。 ...
ValueError: Error reading image Filepath or SimpleITK object
03-27
嗯，用户遇到了使用SimpleITK读取图像文件时的ValueError问题，我需要帮他们解决。首先，我得回想一下常见的导致这个错误的原因。可能的情况包括文件路径错误、文件格式不支持、文件损坏，或者权限问题。 首先，...
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