科研文献|常见豆类根际的持久微生物组成员：空间、时间和植物基因型的综合分析

​研究介绍

自然存在的土壤微生物群对实现农业集约化和可持续发展意义重大，管理微生物群落以支持植物健康的全部潜力尚未实现，部分原因是仍然难以确定哪些成员对植物最重要，然而，在不同的田间条件和植物发育过程中始终与植物物种相关联的微生物可能与宿主或宿主环境互动。因此了解植物与其相关微生物组之间的关系，包括直接与植物接触的关键或“核心”成员与短暂关联的成员的区别至关重要。

研究目的

应用宏观生态学的方法和概念来确定核心细菌、古细菌和真菌根微生物组的持久成员，包括预期对植物农业很重要的多个梯度和驱动因素类别。

材料与方法


分析：
R：统计分析，包括丰度-占用分析，sloan中性模型拟合、数据可视化
iCAMP ：量化装配过程
MENAP（分子生态网络分析管道）：计算共现网络和全局网络属性；
Cytoscape v.3.5.1 ：进行共现网络和全局网络属性可视化。

结果与讨论

Fig. 1在美国种植地点的常见豆类根茎中始终检测到大量微生物。丰度 - 占有率分